¿En qué consiste esta integración de datos?

Consiste en integrar los registros biológicos del país, que han sido publicados por otros países o redes internacionales de cooperación, a los canales de participación del SiB Colombia. Desde el Equipo Coordinador del SiB Colombia se han identificado cuatro (4) conjuntos de datos esenciales: eBird, iNaturalist, GBIF y Xeno-canto. Cada una de estas fuentes de datos contiene información valiosa, tomada a partir de colecciones biológicas, iniciativas de ciencia participativa y registros con datos significativos asociados (ej. sonidos, imágenes). En conjunto, el volumen de datos abiertos sobre biodiversidad disponible para ser integrado desde las fuentes mencionadas, es de 3.773.350 de registros.

¿Quieres conocer en detalle las cifras relacionadas con la integración de datos desde repositorios globales?

Consulta el reporte anual de integración de datos desde repositorios globales – 2018

Pasos para integrar los datos

1. Selección de las fuentes de datos.
2. Solicitud y descarga de los datos.
3. Estandarización Darwin Core y definición de los campos a publicar.
4. Validación y limpieza de los datos.
5. Elaboración de metadatos en IPT.
6. Carga de datos y publicación en IPT.
7. Integración a los canales de participación del SiB Colombia.

¿Por qué es importante?

Desde diferentes aproximaciones, cada uno de los conjuntos de datos que hacen parte de este proceso genera un aporte significativo en la consolidación de información sobre biodiversidad disponible a través del SiB Colombia. La integración de estos datos, resulta una tarea fundamental para la consolidación de las cifras de país y un aporte fundamental en la consolidación del inventario nacional de la biodiversidad.

Repositorios globales integrados

eBird Colombia

eBird, liderado por el Laboratorio de Ornitología de Cornell, es el proyecto de ciencia participativa sobre biodiversidad más grande del mundo. Cuenta con más de 500 millones de registros de aves que comparten miles de pajareros alrededor del mundo. Una iniciativa colaborativa que cuenta con cientos de organizaciones socias, así como miles de expertos regionales, y cientos de miles de usuarios.

eBird Colombia integra observaciones de las aves del país, gracias el esfuerzo de cientos de investigadores a nivel global que se suman a esta red de ciencia participativa nacional. Los datos de eBird documentan la distribución, abundancia, uso de hábitat y tendencias de las aves a través de listas de especies recolectadas dentro de un marco científico simple. Los pajareros indican cuándo, dónde y cómo fueron a pajarear, y luego documentan en una lista de chequeo todas las aves observadas o escuchadas durante la jornada.

¿Sabes cuántas especies se registran en Colombia a través de eBird Colombia? ¿En qué departamento se concentra la mayor cantidad de registros?Descúbrelo en el reporte anual de integración de datos desde repositorios globales 2018.

Conjunto de datos repatriado disponible en: https://doi.org/10.15472/zso3xd

GBIF

La Infraestructura Global de Información sobre Biodiversidad – GBIF, es una red de gobiernos y organizaciones que facilita la publicación de datos y pone a disposición de todo el mundo, la información sobre diversidad biológica que investigadores y ciudadanos comparten en línea sin importar su ubicación geográfica. Colombia, considerado un país megadiverso, cuenta con una importante cantidad de datos disponibles a través de GBIF aportados por organizaciones de distintos países, que cuentan con evidencias de la presencia de especies en el territorio nacional.

Este conjunto de datos comprende 502.426 registros biológicos publicados para Colombia a través de la GBIF (a 28 de diciembre de 2018). Más del 70% de los registros corresponden a especímenes depositados en colecciones biológicas fuera de Colombia, entre ellas, el Missouri Botanical Garden es la organización internacional que más registros aporta para Colombia, con 124960 especímenes de plantas depositados en esta colección biológica de Estados Unidos. Descubre más en el reporte anual de integración de datos desde repositorios globales 2018.

Conjunto de datos repatriado disponible en: https://doi.org/10.15472/xqv1re

Naturalista Colombia

Es una de las aplicaciones de ciencia participativa más populares del mundo, iNaturalist ayuda a identificar las plantas y los animales que nos rodean. Esta iniciativa permite conectarse con una comunidad de más de 750.000 científicos y naturalistas que pueden ayudar a los usuarios a aprender más sobre la naturaleza. Además, al registrar y compartir las observaciones, se crean datos con calidad de investigación para que los científicos puedan conocer y proteger la naturaleza. iNaturalist es una iniciativa conjunta de la Academia de Ciencias de California y la National Geographic Society. En Colombia, esta apuesta tecnológica que articula ciencia y conocimiento no experto, recibe el nombre de Naturalista Colombia y es una herramienta esencial dentro de la estrategia nacional de ciencia participativa que lidera el Instituto Humboldt.

Los datos que reciben confirmación de identificación por parte de tres o más usuarios de la plataforma son elevados a ‘Grado de investigación’ (Research grade), esto permite a iNaturalist mantener un mecanismo permanente para segmentar estos datos. Los registros en esta categoría para Colombia (que son los que hacen parte de la integración) suman 26.967, con corte a 28 de diciembre 2018. Más de 4.000 especies son aportados a partir de este conjunto de datos, en su gran mayoría evidencia de aves, plantas e insectos. Descubre más en el reporte anual de integración de datos desde repositorios globales 2018.

Conjunto de datos repatriado disponible en: https://doi.org/10.15472/gsxge8

Xeno-canto

Xeno-canto es una iniciativa web dedicada a compartir sonidos de aves de todo el mundo. Científicos investigadores, observadores de aves o simplemente usuarios curiosos pueden escuchar, descargar y explorar las grabaciones de los sonidos de aves presentes en toda esta colección. La Fundación Xeno-canto para Sonidos de la Naturaleza (Xeno-canto, XC) tiene como objetivo popularizar la grabación, mejorar la accesibilidad y aumentar el conocimiento de sonidos de aves en todo el mundo. La fundación tiene su sede en Holanda, fue fundada en 2008 y es conocida oficialmente por su nombre holandés “Stichting Xeno-canto voor Natuurgeluiden”. Las grabaciones presentes en Xeno-canto, son compartidas por una creciente comunidad de miles de grabadores de todo el mundo, observadores de aves aficionados y profesionales por igual. El objetivo de Xeno-canto es tener representación de todos los sonidos de las aves del mundo, es decir, de todos los taxones, inclusive a nivel de subespecie, su repertorio completo, toda la variabilidad geográfica, en todas las etapas de desarrollo.

El conjunto de datos de Xeno-canto comprende 4.034 registros sonoros de más de 780 especies de aves de Colombia. Cuenta con datos de 1989 al año 2017, e incluye más de 300 aves identificadas a nivel de subespecie. Descubre más en el reporte anual de integración de datos desde repositorios globales 2018.

Conjunto de datos repatriado disponible en: https://doi.org/10.15472/lo4iij