El estándar Darwin Core (DwC) permite la consolidación de datos sobre biodiversidad para compartir, usar y reusar la información de manera organizada, clara y completa.
El modelo de datos conceptual del estándar es un esquema con una tabla principal, mejor conocida como core. Los core del DwC son: listas de especies (taxon Core), registros biológicos (occurrence Core) o registros de eventos de muestreo (event Core).
El DwC está compuesto por categorías que se utilizan para agrupar conjuntos de elementos de acuerdo a su naturaleza. Cada elemento a su vez, está compuesto por una definición, especificaciones y requerimientos. Los elementos pueden hacer parte de todos o algunos de los core.
Adicionalmente, existen extensiones que se pueden asociar principalmente al core. Las extensiones también están conformadas por elementos los cuales son usados para documentar información adicional y específica que no se relaciona dentro del core (ej., descripción de las especies, rasgos funcionales, información genética, entre otros). Las extensiones pueden ser compatibles con todos o algunos de los core.
En esta página se presenta una aplicación del DwC en español y enfocada a la necesidades de país, la cual contiene a mano derecha una tabla de contenido con las categorías y extensiones del estándar, que llevan a su vez al listado de elementos que conforman cada categoría o extensión. Dentro del listado de elementos es posible dirigirse directamente al elemento de interés en donde se encontrará la siguiente información detallada:
- Definición: Texto que describe el alcance del elemento.
- Comentarios: Texto que complementa, a manera de anotación o aclaración, la información de la definición.
- Ejemplo: Ejemplos textuales que hacen referencia a cómo se puede documentar el elemento.
- Elementos relacionados: Elementos del estándar DwC que tienen relación estrecha con el elemento que esta siendo descrito.
- Core (Obligatoriedad): core al que hace parte el elemento y su obligatoriedad dentro de cada uno de estos (opcional, condicional, obligatorio).
-
Vocabulario controlado: Opciones de textos preestablecidos que deben documentarse de manera obligatoria dentro del elemento. No se puede documentar información diferente a la relacionada en los vocabularios controlados. Adicionalmente, en este campo se puede hacer un redireccionamiento al listado y definiciones de los vocabularios controlados del elemento.
- La documentación oficial y en inglés del estándar se puede consultar en: https://dwc.tdwg.org/terms/
- La documentación oficial y en inglés de las extensiones: https://rs.gbif.org/extensions.html
Fecha de última actualización: mayo de 2024.
Categorías DwC
Elementos de Registro
basisOfRecord (Base del registro)
| Definición | Denota el origen o evidencia específica de la que se deriva el organismo. Documente este elemento de acuerdo a las definiciones e indicaciones que acompañan el vocabulario controlado. Para este elemento se debe emplear el vocabulario controlado en inglés. |
| Comentarios | Sólo las colecciones biológicas pueden documentar PreservedSpecimen, si el registro corresponde a un espécimen depositado, pero el reporte no lo genera la colección biológica, se documenta HumanObservation y se documentan los elementos collectionCode, catalogNumber y disposition. |
| Elementos relacionados | type |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Obligatorio) |
| Vocabulario controlado | PreservedSpecimen HumanObservation LivingSpecimen FossilSpecimen MachineObservation MaterialSample MaterialCitation |
| Definición | Especifica el tipo de evidencia que da origen al registro, ampliando la información presente en el elemento basisOfRecord. Documente este elemento de acuerdo a las definiciones e indicaciones que acompañan el vocabulario controlado. |
| Elementos relacionados | basisOfRecord |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Obligatorio) Evento de muestreo (Opcional) |
| Vocabulario controlado | StillImage MovingImage Sound PhysicalObject Event |
institutionCode (Código de la institución)
| Definición | El nombre completo de la institución que custodia el espécimen o la información del registro; seguido por su acrónimo en paréntesis, si tiene. |
| Ejemplo | Ministerio de Ambiente y Desarrollo Sostenible (MADS) Universidad de Antioquia (UdeA) Jardín Botánico de Bogotá José Celestino Mutis (JBB) |
| Elementos relacionados | institutionID |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Obligatorio) Evento de muestreo (Recomendado) |
institutionID (ID de la institución)
| Definición | Un identificador, preferiblemente el NIT, de la institución registrada en el elemento institutionCode. |
| Ejemplo | 586.697.465-1 890.105.528-3 860.030.197-0 |
| Elementos relacionados | institutionCode |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Obligatorio) Evento de muestreo (Opcional) |
collectionCode (Código de la colección)
| Definición | El nombre, acrónimo, código alfanumérico, o iniciales que identifican la colección o conjunto de datos del que procede el organismo. Aunque es válido el uso del acrónimo que implemente la colección internamente se recomienda hacer uso del acrónimo registrado en: - GBIF Registry of Scientific Collections (https://www.gbif.org/grscicoll/collection/search) - Registro Único Nacional de Colecciones Biológicas-RNC (http://rnc.humboldt.org.co/admin/index.php/registros/colecciones) |
| Ejemplo | COL ANDES-E FMB |
| Elementos relacionados | collectionID |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Condicional). Obligatorio para especímenes depositados en una colección biológica |
collectionID (ID de la colección)
| Definición | Un identificador de la colección registrada en el elemento collectionCode. Se recomienda hacer uso de los identificadores registrados en: - GBIF Registry of Scientific Collections (https://www.gbif.org/grscicoll/collection/search) - Registro Único Nacional de Colecciones Biológicas-RNC (http://rnc.humboldt.org.co/admin/index.php/registros/colecciones) |
| Ejemplo | https://www.gbif.org/grscicoll/collection/0d0e813e-dc60-4357-82b1-810d0af640a5 RNC:250 |
| Elementos relacionados | collectionCode |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Condicional). Obligatorio para especímenes depositados en una colección biológica |
datasetName (Nombre del conjunto de datos)
| Definición | El título que identifica el conjunto de datos referenciado en ID del conjunto de datos. |
| Ejemplo | Colombia Bio Fondo Adaptación Boyacá Bio Cenipalma |
| Elementos relacionados | datasetID |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Lista de chequeo (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
datasetID (ID del conjunto de datos)
| Definición | Un identificador para conjunto o sub conjunto de datos. Puede ser un identificador único global como un DOI o un identificador específico de una colección o institución. |
| Ejemplo | doi.org/10.15472/8xjulj IAvH:CE16-062:8956:2016 SINCHI:CE17-845:2017 |
| Elementos relacionados | datasetName |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Lista de chequeo (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
| Definición | La fecha más reciente en la que se haya modificado el registro. Debe estar documentada en el esquema de codificación ISO 8601 (AAAA-MM-DD o para un intervalo de fechas: AAAA-MM-DD/AAAA-MM-DD). |
| Ejemplo | 2010 2010-01 2010-01-17 2009/2010 2009-02/2010-01 2009-02/10 2009-02-12/2009-10-08 2010-01-17/18 |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Lista de chequeo (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
| Definición | El idioma del conjunto de datos. |
| Comentarios | Documente este elemento de acuerdo al vocabulario controlado de la norma ISO 639-1 de 2 letras en minúscula, como se muestra a continuación: es (=Para español) en (=Para inglés) |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Lista de chequeo (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
| Vocabulario controlado | Consultar en: http://www.loc.gov/standards/iso639-2/php/code_list.php |
| Definición | Información sobre los derechos, licencias o permisos que establece el publicador sobre el uso del recurso. Se recomienda no documentar este elemento debido a que la licencia se especifica con mayor detalle en los metadatos que acompañan la publicación del conjunto de datos. |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Lista de chequeo (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
rightsHolder (Titular de los derechos)
| Definición | El nombre de persona u organización propietaria o administradora de los derechos sobre el recurso. |
| Ejemplo | Secretaría de Agricultura Ministerio de Medio Ambiente Secretaría Distrital de Ambiente |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Lista de chequeo (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
accessRights (Derechos de acceso)
| Definición | Información sobre los derechos de acceso o restricciones basadas en políticas de privacidad, seguridad, u otras. |
| Ejemplo | Sólo para uso no comercial. |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Lista de chequeo (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
bibliographicCitation (Citación bibliográfica)
| Definición | Indica la manera de citar el registro cuando sea utilizado, incluyendo la referencia del recurso al que pertenece el registro. Se recomienda incluir el doi si se tiene junto con los detalles bibliográficos para identificar el recurso claramente. |
| Ejemplo | Raz L, Agudelo H (2019). Herbario Nacional Colombiano (COL). Versión 13.12. Universidad Nacional de Colombia. Occurrence dataset https://doi.org/10.15472/ea8sek. occurrenceID: 1a399be0-9ca9-4efe-84be-b8974a5548fc |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Lista de chequeo (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
| Definición | Una URL a un recurso asociado, el cual es de alguna forma referenciado o citado por el registro descrito. |
| Ejemplo | http://arctos.database.museum/guid/MVZ:Mamm:165861 https://www.gbif.org/species/2474724 |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Lista de chequeo (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
ownerInstitutionCode (Código de la institución propietaria)
| Definición | El nombre completo (o acrónimo) de la institución que tiene la propiedad del objeto o de la información consignada en el registro. Usar sólo si la organización propietaria de los datos es diferente a la organización publicadora consignada en el elemento institutionCode. |
| Ejemplo | Ministerio de Ambiente y Desarrollo Sostenible (MADS) Celsia S.A. E.S.P. |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
informationWithheld (Información retenida)
| Definición | Información adicional que existe sobre el registro, pero que no ha sido compartida en la publicación. |
| Ejemplo | La información de ubicación no es provista para especies amenazadas La identidad de los colectores es retenida Pregunte acerca de muestras de tejido |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Lista de chequeo (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
dataGeneralizations (Generalización de los datos)
| Definición | Medidas adoptadas para que los datos compartidos sean menos específicos o completos. Sugiere que los datos con mayor detalle existen y pueden estar disponibles bajo petición. |
| Ejemplo | Coordenadas generalizadas a partir de las coordenadas originales del GPS a la celda más cercana de la grilla |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
dynamicProperties (Propiedades dinámicas)
| Definición | Una lista de las medidas, hechos o características adicionales sobre el organismo. Su intención es proporcionar un mecanismo estructurado para la representación de los datos. Debe estar documentado en el esquema de codificación JSON {“Medida”:”Valor”}. Por facilidad en la documentación se recomienda el uso de la extensión del estándar Darwin Core de Medidas y Hechos en lugar de este elemento. |
| Ejemplo | {“pesoEnGramos”:”120”, “evidenciaDeLaIdentificación”: “secuencia de citocromo B”} {“alturaEnMetros”:”1.5”, “distribuciónDelTaxón”: “Amazonas, Colombia”, “temperaturaDelAireEnCelsius”: “22”} {“naturalezaDelID”:”identificación de experto”} |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
Registro Biológico
occurrenceID (ID del Registro biológico)
| Definición | Un identificador único del registro biológico (observación, ejemplar, fotografía, etc.). En ausencia de un identificador único global persistente, se recomienda construir uno a partir de la combinación: Cuando pertenece a una observación: [código corto de la institución]:[palabra(s) clave del recurso]:[número de campo/número consecutivo] Cuando pertenece a una colección: [código corto de la institución]:[código de la colección]:[número de catálogo]. No debe contener espacios en blanco o caracteres especiales. Si usted ya maneja en su conjunto de datos un identificador único por registros biológico, puede usarlo como identificador en el conjunto de datos. |
| Ejemplo | Promigas:Compensacion-SanJuan:Fauna-00001 UCO:RESCATE_FAUNA_MULATOSII:1 UNIVALLE:CRM-UV:1974-001-1 |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Obligatorio) |
catalogNumber (Número de catálogo)
| Definición | Un identificador (preferiblemente único) asignado al espécimen, muestra o lote en la colección biológica. Puede repetirse en caso de que los especímenes están agrupados en la colección (Lote, Frasco, Caja, etc). Debe documentarse de la misma forma que está en la etiqueta. |
| Ejemplo | 00001 1974-001-1 1732a ANDES-E0813 Lepid0784 |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Condicional). Obligatorio para especímenes depositados en una colección biológica |
recordNumber (Número del registro)
| Definición | Un identificador dado al registro biológico en el momento en que fue registrado, sirve como un vínculo entre las anotaciones de campo y el registro biológico. No es el mismo catalogNumber, el cual es usualmente asignado una vez el espécimen ingresa a la colección. |
| Ejemplo | OPP 7107 JARM-0008 AFT 143 |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) |
| Definición | Una lista (en una fila continua y separada por una barra vertical “|”) de los nombres de las personas (observadores o recolectores) responsables de realizar el registro. El colector u observador principal, especialmente si está asociado al recordNumber tomado en campo, se debe listar en primer lugar. Se debe mantener el mismo formato del nombre a lo largo de todos los registros y se recomienda evitar el uso de solo iniciales ya que esto genera ambigüedades para reconocer a las personas que realizaron el registro, de ser posible siempre escriba nombres completos. Documente el nombre de las personas y evite documentar nombres de grupos u organizaciones. |
| Ejemplo | Eduardo Amat García Javier Maldonado Ocampo Mónica Andrea Sánchez Torres | Esteban Andrés Novoa López |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Condicional). Obligatorio cuando el registro está asociado a un permiso de recolección o de acceso a recursos genéticos - Recomendado para la buena documentación de un registro biológico |
recordedByID (ID del registrador)
| Definición | Una lista (en una fila continua y separada por una barra vertical “|”) de los ID de las personas (observadores o recolectores), grupos u organizaciones responsables de realizar el registro. Estos identificadores deben corresponder al ORCID, Wikidata u algún otro identificador único controlado. El orden en este elemento no indica una prioridad en la citación ni ningún otro tipo de relación jerárquica. |
| Ejemplo | https://orcid.org/0000-0001-6215-3617 | https://orcid.org/0000-0003-1691-239X https://www.wikidata.org/entity/Q28913658 |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) |
individualCount (Número de individuos)
| Definición | Número de individuos presentes en el momento del registro biológico (observación, ejemplar, fotografía, etc.). Utilice este elemento si todos los conteos corresponden a individuos, de lo contrario utilice organismQuantity y organismQuanitityType. |
| Ejemplo | 1 25 282 |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) |
organismQuantity (Cantidad del organismo)
| Definición | Valor que representa una cantidad colectada u observada del organismo, expresada en un sistema de medida estándar para el organismo como cepas, células, porcentaje de biomasa, etc. Documentar este elemento junto con el elemento organismQuantityType. |
| Comentarios | El sistema de medida se debe documentar en el elemento organismQuantityType, como se muestra en el ejemplo a continuación: Para el registro de cobertura de líquenes: organismQuantity: 30 / organismQuantityType: % de cobertura Para la abundancia de fitoplancton: organismQuantity: 253 / organismQuantityType: Células por litro Para comunidades vegetales: organismQuantity: r / organismQuantityType: Escala Braun-Blanquet |
| Ejemplo | 30 253 r |
| Elementos relacionados | organismQuantityType |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Condicional). Obligatorio cuando el registro está asociado a un permiso de recolección o de acceso a recursos genéticos - Recomendado para la buena documentación de un registro biológico |
organismQuantityType (Tipo de cantidad del organismo)
| Definición | Sistema de medida estándar asociado a la cantidad de organismos. Documentar este elemento junto con el elemento organismQuantity. |
| Comentarios | La cantidad de organismos se debe documentar en el elemento organismQuantity, como se muestra a continuación: Para el registro de cobertura de líquenes: organismQuantity: 30 / organismQuantityType: % de cobertura Para la abundancia de fitoplancton: organismQuantity: 253 / organismQuantityType: Células por litro Para comunidades vegetales: organismQuantity: r / organismQuantityType: Escala Braun-Blanquet |
| Ejemplo | Porcentaje de cobertura Células por litro Escala Braun-Blanquet |
| Elementos relacionados | organismQuantity |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Condicional). Obligatorio cuando el registro está asociado a un permiso de recolección o de acceso a recursos genéticos - Recomendado para la buena documentación de un registro biológico |
| Definición | El sexo de el(los) organismo(s) representado(s) en el registro. Si en un mismo registro cuenta con varios organismos de diferentes sexos, genere registros (filas) diferentes por cada sexo. Se recomienda el uso del vocabulario sugerido disponible para este elemento. |
| Ejemplo | Hembra Hermafrodita Macho Desconocido Indeterminado Ginandromorfo |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) |
lifeStage (Etapa de desarrollo)
| Definición | La etapa de vida de el(los) organismo(s) en el momento del registro. Si en un mismo registro cuenta con varios organismos en diferentes etapas de vida, genere registros (filas) diferentes por cada etapa de vida. Se recomienda el uso del vocabulario sugerido disponible para este elemento. |
| Ejemplo | Huevo Juvenil Adulto Cigoto Embrión Larva Esporófito Espora Gametofito Gameto Pupa Plántula Floración Fructificación |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) |
reproductiveCondition (Condición reproductiva)
| Definición | Condición reproductiva de el(los) organismo(s) en el momento del registro. Se recomienda el uso de un vocabulario controlado. |
| Ejemplo | No reproductiva En gestación Floración Fructificación |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
| Definición | La categorización de individuos para especies eusociales de algunos artrópodos. |
| Comentarios | Se recomienda el uso de un vocabulario controlado para cada taxón específico. |
| Ejemplo | Reina Macho alado Intercasta Trabajador menor Soldado Ergatoide |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Lista de chequeo (Opcional) |
| Definición | Descripción del comportamiento de el(los) organismo(s) en el momento del registro. Se recomienda el uso de un vocabulario controlado. |
| Ejemplo | Posando Alimentándose Corriendo |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
vitality (Estado de vitalidad)
| Definición | Indicación de la vitalidad del organismo en el momento de la colecta u observación (vivo o muerto). |
| Comentarios | Se requiere el uso de un vocabulario controlado. Usar este elemento en registros documentados como PreservedSpecimen, MaterialSample, o HumanObservation en el elemento basisOfRecord. |
| Ejemplo | Vivo Muerto Grupo mixto Incierto No evaluado |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
establishmentMeans (Medios de establecimiento)
| Definición | Una afirmación que de cuenta si un organismo ha sido introducido a un lugar y tiempo determinado a través de actividad humana directa o indirecta. Documente este elemento de acuerdo a las definiciones e indicaciones que acompañan el vocabulario controlado. Para este elemento se debe emplear el vocabulario controlado en inglés. Se recomienda documentar este elemento acompañado de los elementos degreeOfEstablishment y pathway. |
| Comentarios | Actualmente el estándar DwC no posee un elemento que permita documentar de manera adecuada la información de endemismos, este elemento es el más cercano para la documentación de esta información por lo cual se incluye el vocabulario ‘Endémica’. |
| Elementos relacionados | degreeOfEstablishment, pathway |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
| Vocabulario controlado | native nativeReintroduced introduced introducedAssistedColonisation vagrant uncertain Endémica |
degreeOfEstablishment (Grado de establecimiento)
| Definición | El grado en cual el organismo sobrevive, se reproduce y expande su rango de distribución en un lugar y tiempo determinado. Documente este elemento de acuerdo a las definiciones e indicaciones que acompañan el vocabulario controlado. Para este elemento se debe emplear el vocabulario controlado en inglés. Se recomienda documentar este elemento acompañado de los elementos establishmentMeans y pathway. |
| Elementos relacionados | establishmentMeans, pathway |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
| Vocabulario controlado | native cultivated released established colonising widespreadInvasive |
pathway (Ruta de introducción)
| Definición | El proceso por el cual un organismo llegó a un lugar y tiempo determinado. Documente este elemento de acuerdo a las definiciones e indicaciones que acompañan el vocabulario controlado. Para este elemento se debe emplear el vocabulario controlado en inglés. Se recomienda documentar este elemento acompañado de los elementos establishmentMeans y degreeOfEstablishment. |
| Elementos relacionados | establishmentMeans, degreeOfEstablishment |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
| Vocabulario controlado | releasedForUse otherEscape transportContaminant transportStowaway corridor unaided |
occurrenceStatus (Estado del registro biológico)
| Definición | Estado que da cuenta de la presencia o ausencia de un taxón en una ubicación. Documente este elemento de acuerdo a las definiciones e indicaciones que acompañan el vocabulario controlado. Para este elemento se debe emplear el vocabulario controlado en inglés. |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Condicional). Obligatorio para registros marinos - Recomendado para la buena documentación de un registro biológico |
| Vocabulario controlado | present absent |
| Definición | Una lista (en una fila continua y separada por una barra vertical “|”) de las preparaciones y los métodos de conservación de un ejemplar o una muestra del ejemplar. Adicionalmente, si el espécimen fue colectado bajo un permiso de recolección de especímenes o acceso a recursos genéticos, debe indicar si fue una colecta temporal o una colecta definitiva seguido por el tipo de preparación. |
| Ejemplo | Colecta definitiva: Animal completo (ETOH) Colecta definitiva: Preparación de muestra microbiológica Colecta temporal: Extracción de ADN Piel | Cráneo | Esqueleto Animal completo (ETOH) | Tejido (EDTA) Fósil Molde Fotografía |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Condicional). Obligatorio cuando el registro está asociado a un permiso de recolección o de acceso a recursos genéticos |
| Definición | El estado actual de un espécimen en relación a la colección identificada en collectionCode o collectionID. Se recomienda el uso de un vocabulario controlado. Si el espécimen fue colectado bajo un permiso de recolección de especímenes o acceso a recursos genéticos y fue entregado a una colección biológica se debe documentar “En colección”, de lo contrario dejar vacío el elemento. |
| Ejemplo | En colección Extraviado Ejemplar testigo Duplicados en otro lugar |
| Elementos relacionados | collectionCode, collectionID |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Condicional). Obligatorio cuando el registro está asociado a un permiso de recolección o de acceso a recursos genéticos |
verbatimLabel (Etiqueta original)
| Definición | Texto que representa la información literal que está presente en la etiqueta, carácter por carácter. Libre de interpretación, traducción o transliteración. |
| Comentarios | El contenido de este elemento no debe incluir ningún tipo de embellecimiento, prefijos, encabezados u otras adiciones al texto original. Las abreviaciones no deben ser extendidas y posibles errores de tipeo no deben ser corregidos. Las nuevas líneas presentes en la etiqueta se deben representar utilizando una barra vertical “ | ”. La práctica recomendada es utilizar solamente caracteres en la codificación UTF-8 y poner el comentario “El elemento verbatimLabel es derivado de una transcripción humana” en el elemento occurrenceRemarks. |
| Ejemplo | CARACTERIZACION DE LA FLORA DEL DEPARTAMENTO DEL CASANARE | PIPER* | Peperomia quadrangularis (J.V.Thmps.) A. Dietr. | Det: M.P. Córdoba /sep 2011 | Enredadera | COLOMBIA: Dpto Casanare, Mpio Tauramena, Vda La Urama, Localidad La Mata de la Urama Lat: 5° 03’,19,2” N, Long: 72° 48’ 58,8” W . Altitud: 182 m s.n.m., 28 Enero 2011. | Col: M .P.Córdoba, R. Ávila, L.Miranda y C. Pérez. | No. Col.: M.P.Córdoba 6161 | GOBERNACIÓN DEL CASANARE-WWF-FUNDACIÓN OMACHA | 119 |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
otherCatalogNumbers (Otros números de catálogo)
| Definición | Una lista (en una fila continua y separada por una barra vertical “|”) de números de catálogos anteriores o alternos, u otros identificadores usados por personas para el mismo registro biológico, ya sea en el actual o cualquier otro conjunto de datos o colección. |
| Ejemplo | CFMNH:Mammal:1234 NPS YELLO6778 | MBG 33424 |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
associatedMedia (Medios asociados)
| Definición | Una lista (en una fila continua y separada por una barra vertical “|”) de los identificadores (publicación, referencia bibliográfica, identificador único global, URI) de los medios asociados al registro biológico. Se recomienda usar la extensión Simple Multimedia o Audubon Media Description las cuales cuentan con más elementos para describir la información multimedia asociada. |
| Ejemplo | https://sinchi.org.co/ciacol/ficha/24/Hypoclinemus%20mentalis https://ia801004.us.archive.org/0/items/staphylococcusaureus.JPG | https://ia903100.us.archive.org/33/items/CMPUJH012-macro.jpg |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
associatedOccurrences (Registros biológicos asociados)
| Definición | Una lista (en una fila continua y separada por una barra vertical “|”) de los identificadores de otros registros biológicos y su relación con este registro. Aplica para relaciones con organismos de diferente grupo taxonómico y se recomiendo documentar junto a el elemento associatedTaxa. Se recomienda hacer uso de la extensión Resource Relationship para documentar en más detalle la relación entre los registros biológicos asociados. |
| Ejemplo | http://arctos.database.museum/guid/MSB:Mamm:292063?seid=3175067 | http://arctos.database.museum/guid/MSB:Mamm:292063?seid=3177393 SELVA:Anillamiento:AA7330a |
| Elementos relacionados | associatedTaxa |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
associatedReferences (Referencias asociadas)
| Definición | Una lista (en una fila continua y separada por una barra vertical “|”) de los identificadores (publicación, referencia bibliográfica, identificador único global, URI) de la literatura asociada al registro biológico. Se recomienda hacer uso de la extensión Literature References la cual cuenta con más elementos para describir la información de referencias asociada. |
| Ejemplo | http://www.sciencemag.org/cgi/content/abstract/322/5899/261 Christopher J. Conroy, Jennifer L. Neuwald. 2008. Phylogeographic study of the California vole, Microtus californicus Journal of Mammalogy, 89(3):755-767. |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
associatedSequences (Secuencias asociadas)
| Definición | Una lista (en una fila continua y separada por una barra vertical “|”) de los identificadores (publicación, identificador único global, URI) de la información de la secuencia genética asociada al registro biológico. Se recomienda hacer uso de la extensión GGBN Amplification Extension la cual cuenta con más elementos para describir la información de secuencia genética asociada. |
| Ejemplo | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/U34853.1 https://www.boldsystems.org/index.php/Public_RecordView?processid=ABBAC141-12 |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
associatedTaxa (Taxones asociados)
| Definición | Una lista (en una fila continua y separada por una barra vertical “|”) de los identificadores o nombres de taxones y su asociación con el registro biológico. |
| Ejemplo | Huésped: Quercus alba Parásito: Apis mellifera |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
occurrenceRemarks (Comentarios del registro biológico)
| Definición | Comentarios o anotaciones sobre el registro biológico. Se recomienda que la longitud de la descripción no supere 20 palabras. |
| Ejemplo | Muerto en la vía Registrado en el campus de la Universidad |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) |
Organismo
| Definición | Un identificador del organismo. Pretende facilitar el remuestreo del mismo individuo con fines generalmente de monitoreo. Aves anilladas, fotos de mamíferos acuáticos, árboles remuestreados, etc. |
| Ejemplo | U.amer. 44 CC09477 Orca J 23 |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
organismName (Nombre del organismo)
| Definición | El nombre textual dado a un organismo en un estudio o el nombre en la etiqueta asignada originalmente. |
| Ejemplo | Huberta Willy la Ballena Asesina Cheeta |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
organismScope (Alcance del organismo)
| Definición | Puede ser utilizado para indicar si la instancia del organismo representa un organismo discreto o un tipo particular de agregación. Se recomienda el uso de un vocabulario controlado. Este elemento no está destinado a ser utilizado para especificar una categoría taxonómica. |
| Ejemplo | Organismo multicelular Manada Clon Colonia |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
associatedOrganisms (Organismos asociados)
| Definición | Una lista (en una fila continua y separada por una barra vertical “|”) de los identificadores de otros organismos y su relación con el organismo documentado. Aplica para relaciones con organismos del mismo grupo taxonómico. Se recomienda hacer uso la extensión Resource Relationship para documentar en más detalle la relación entre los organismos asociados. |
| Ejemplo | Hermano de: FMNH:Mamífero:1234 | Hermano de: FMNH:Mamífero:1235 Hijo de: MLS:sau:438 |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
previousIdentifications (Identificaciones previas)
| Definición | Una lista (en una fila continua y separada por una barra vertical “|”) de asignaciones taxonómicas que se le han dado al organismo anteriormente. Puede contener la información de quién y cuándo realizó la identificación anterior. Se recomienda hacer uso de la extensión Identification (https://tools.gbif.org/dwca-validator/extension.do?id=dwc:Identification#Identification)para el caso de colecciones biológicas. |
| Ejemplo | Pinus abies Anthus sp., identificado en campo por G. Iglesias | Anthus correndera, Identificado por el experto C. Cicero 2009-02-12 basado en morfología Leptolyngbya cf. polysiphoniae | Leptolyngbya sp. |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
organismRemarks (Comentarios del organismo)
| Definición | Comentarios o anotaciones sobre el organismo registrado. Se recomienda que la longitud de la descripción no supere 20 palabras. |
| Ejemplo | Uno de una camada de seis Fruto inmaduro cubierto por un indumento rojizo |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
Muestra del Material
materialSampleID (ID de muestra del material)
| Definición | Un identificador para muestras de material (no hace referencia a muestras digitales sino físicas, como exicados o tejidos). En ausencia de un identificador único global persistente, puede construir uno usando una combinación a partir del occurrenceID, de tal forma que el materialSampleID sea globalmente único. Se recomienda hacer uso de la extensión GGBN Material Sample Extension para documentar en más detalle la información relacionada con la muestra. |
| Ejemplo | IAvH:IAvH-CT-1:Tejido 06809dc5-f143-459a-be1a-6f03e63fc083 IAvH-ABJ788 |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
Evento
parentEventID (ID parental del evento)
| Definición | Un identificador único para la categoría superior del evento de muestreo. Por ejemplo, el identificador del muestreo de un cuadrante, parcela o transecto independientemente del tiempo o temporada cuando se realice el muestreo. Este identificador es más general que el eventID y puede agrupar varios eventID. |
| Comentarios | Este elemento debe estar acompañado siempre del elemento eventID, como se muestra en el ejemplo a continuación: A1 como parentEventID para identificar una parcela, cada sub-parcela con su propio eventID (A1:1, A1:2, etc.) BENTOS como parentEventID para identificar un evento de muestreo y cada parte del evento con su propio eventID (BENTOS:E-1, BENTOS:E-2, etc.) |
| Ejemplo | A1 BENTOS |
| Elementos relacionados | eventID |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
| Definición | Un identificador único para el Evento de muestreo, que ocurre en un lugar y tiempo determinado. Por ejemplo, el identificador del muestreo de un cuadrante, parcela o transecto en un tiempo o temporada específicos. Este identificador es más específico que el parentEventID. |
| Comentarios | Este elemento puede estar acompañado del elemento parentEventID, como se muestra en el ejemplo a continuación: A1:1 | A1:2 como eventID para identificar cada sub-parcela perteneciente a la parcela A1 BENTOS:E-1 | BENTOS:E-2 como EventID para identificar cada parte del evento de muestreo perteneciente al evento BENTOS |
| Ejemplo | A1:1 BENTOS:E-1 |
| Elementos relacionados | parentEventID |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Condicional). Obligatorio cuando el registro es marino - Recomendado para la buena documentación de un registro biológico Evento de muestreo (Obligatorio) |
| Definición | La naturaleza del evento. |
| Comentarios | Se recomienda el uso de un vocabulario controlado. |
| Ejemplo | Muestra Observación Visita al sitio Interacción biótica Bioblitz Expedición Encuesta Proyecto |
| Core (Obligatoriedad) | Evento de muestreo (Opcional) |
samplingProtocol (Protocolo de muestreo)
| Definición | El nombre, la descripción o la referencia del método o protocolo de muestreo usado para realizar el muestreo. Se recomienda acompañar este elemento con el elemento samplingEffort. |
| Comentarios | Si un mismo evento cuenta con varios protocolos de muestreo diferentes, la recomendación es generar un evento (filas) diferente por cada protocolo de muestreo. En el caso que el evento agrupe múltiples protocolos que no puedan ser atribuidos a un registro particular, la práctica recomendada es separar los protocolos por una barra vertical “|”. |
| Ejemplo | Trampa de luz UV Red de niebla Arrastre de fondo Observación ad hoc Punto de conteo |
| Elementos relacionados | samplingEffort |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) Evento de muestreo (Obligatorio) |
sampleSizeValue (Valor del tamaño de la muestra)
| Definición | Un valor numérico para una medición del tamaño (duración de tiempo, longitud, área o volumen) de una muestra en un evento de muestreo. Documentar este elemento junto con el elemento sampleSizeUnit. Se recomienda hacer uso del Sistema Internacional de Unidades (SI) cuando sea posible. |
| Ejemplo | 5.5 10 1 |
| Elementos relacionados | sampleSizeUnit |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Recomendado) |
sampleSizeUnit (Unidad del tamaño de la muestra)
| Definición | La unidad de medida de la magnitud (tiempo de duración, longitud, área o volumen) de una muestra en un evento de muestreo. Documentar este elemento junto con el elemento sampleSizeValue. |
| Ejemplo | m (= Metros) h (= Horas) Trampas-noche Litros |
| Elementos relacionados | sampleSizeValue |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Recomendado) |
samplingEffort (Esfuerzo de muestreo)
| Definición | El esfuerzo de muestreo en tiempo y/o espacio realizado durante el evento de muestreo. Documentar este elemento junto con el elemento samplingProtocol. |
| Ejemplo | 40 trampas-noche 10 horas-observador 10 km caminando 30 km en carro 7 días-trampa 5 horas muestra por 30 eventos de muestreo |
| Elementos relacionados | samplingProtocol |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) Evento de muestreo (Recomendado) |
| Definición | La fecha o el intervalo durante la cual se produjo el evento de observación o colecta de un organismo o muestra. No es adecuado para una fecha en un contexto geológico. Debe estar documentada en el esquema de codificación ISO 8601 (AAAA-MM-DD o para un intervalo de fechas: AAAA-MM-DD/AAAA-MM-DD). |
| Ejemplo | 2010 2010-01 2010-01-17 2009/2010 2009-02/10 2010-01-17/18 2009-02/2010-01 2009-08-08/2009-10-26 |
| Elementos relacionados | year, month, day |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Condicional). Obligatorio cuando el registro está asociado a un permiso de recolección o de acceso a recursos genéticos - Recomendado para la buena documentación de un registro biológico Evento de muestreo (Obligatorio) |
startDayOfYear (Día inicial del año)
| Definición | Día inicial del evento, contando a partir del primer día del año del evento y documentado en formato de números ordinales (siendo “1” el primero de enero y “365” el 31 de diciembre en año no bisiesto). |
| Ejemplo | 1 220 365 |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
endDayOfYear (Día final del año)
| Definición | Día final del evento, contando a partir del primer día del año del evento y documentado en formato de números ordinales (siendo “1” el primero de enero y “365” el 31 de diciembre en año no bisiesto). |
| Ejemplo | 30 300 366 |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
| Definición | Los cuatro dígitos del año durante el cual se produjo el evento de observación o colecta de un organismo o muestra. |
| Comentarios | Si el rango de fechas presente en EventDate abarca varios años, no debe documentar este elemento: eventDate:2021-02-01/2022-05-23 year: month: day: |
| Ejemplo | 2008 1901 |
| Elementos relacionados | eventDate |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
| Definición | El mes en números enteros en que ocurrió durante el cual se produjo el evento de observación o colecta de un organismo o muestra. |
| Comentarios | Si el rango de fechas presente en EventDate abarca más de un mes, no debe documentar este elemento: eventDate:2022-02-10/05-23 year:2022 month: day: |
| Ejemplo | 01 11 |
| Elementos relacionados | eventDate |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
| Definición | El día en números enteros durante el cual se produjo el evento de observación o colecta de un organismo o muestra. |
| Comentarios | Si el rango de fechas presente en EventDate se encuentra dentro del mismo mes, no debe documentar este elemento: eventDate:2022-02-12/15 year:2022 month:02 day: |
| Ejemplo | 09 28 |
| Elementos relacionados | eventDate |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
verbatimEventDate (Fecha original del evento)
| Definición | La representación textual original (según la libreta de campo, formato de datos, o etiqueta de colección) de la información de fecha durante la cual se produjo el evento de observación o colecta de un organismo o muestra. |
| Ejemplo | primavera 1910 4/11/2020 marzo 2002 1999-03-XX 17IV1934 |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
| Definición | La hora o el intervalo de horas en la cual se produjo el evento de observación o colecta de un organismo o muestra. Debe estar documentado en el esquema de codificación ISO 8601. |
| Ejemplo | 14:07 08:40:21 13:00:00/15:30:00 |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) Evento de muestreo (Opcional) |
| Definición | Una categoría estandarizada o la descripción del hábitat en el que ocurrió el evento. |
| Ejemplo | Sabana de roble Estepa de la pre-cordillera |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) Evento de muestreo (Recomendado) |
| Definición | Un identificador dado al evento en campo. A menudo sirve como un vínculo entre las anotaciones de campo y el evento. |
| Ejemplo | RV Sol 87-03-08 MBZ-067 |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
| Definición | Un indicador sobre la existencia o referencia (publicación URI) a las notas de campo; o el texto de las notas tomadas en campo sobre el evento. |
| Ejemplo | Notas disponibles en la Biblioteca Grinnell-Miller Este espécimen fue colectado en un árbol de caracolí, una nota de campo fue descrita para mencionar este evento, eran depredados por Epicrates maurus |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
eventRemarks (Comentarios del evento)
| Definición | Comentarios o anotaciones sobre el evento. Se recomienda que la longitud de la descripción no supere 20 palabras. |
| Ejemplo | Después de las lluvias recientes, el río estuvo cercano a un estado de desbordamiento |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) Evento de muestreo (Recomendado) |
Ubicación
locationID (ID de la ubicación)
| Definición | Un identificador de la región geográfica, división político administrativa o del sitio específico donde se realizó el registro. |
| Comentarios | Se sugiere utilizar un identificador persistente, como el código de la División Política Administrativa de Colombia - DANE (https://www.datos.gov.co/api/views/gdxc-w37w/rows.pdf?accessType=DOWNLOAD) precedida por “CO:” o utilizar MarineRegions (https://www.marineregions.org/) para regiones marinas, como se muestra a continuación: CO:15572 (Código Divipola para el Municipio de Puerto Boyacá en Boyacá) CO:68 (Código Divipola para el Departamento de Santander) http://marineregions.org/mrgid/32556 (Islas del Rosario) |
| Ejemplo | CO:15572 CO:68 http://marineregions.org/mrgid/32556 geonames.org/3674545/ |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
higherGeography (Geografía superior)
| Definición | Una lista (en una fila continua y separada por una barra vertical “|”) de la geografía inmediatamente superior al sitio o ubicación donde se realizó el registro. Si hay modificaciones en la localidad para estandarizar su contenido puede documentar en este elemento los datos originales (sin estandarizar) de esos términos. |
| Comentarios | Este elemento debe estar acompañado de otros elementos del estándar, como se muestra en el ejemplo a continuación: América | Sudamérica | Colombia | Región del Pacífico | Valle del Cauca | La Cumbre | Bitaco (Con los valores resultantes de América del Sur en continent, Colombia en country, Valle del Cauca en stateProvince, La Cumbre en county y Bitaco en municipality). |
| Ejemplo | América | Sudamérica | Colombia | Región del Pacífico | Valle del Cauca | La Cumbre | Bitaco |
| Elementos relacionados | higherGeographyID, continent, country, stateProvince, county, municipality |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
higherGeographyID (ID de la geografía superior)
| Definición | Un identificador de la región geográfica inmediatamente superior a la ubicación donde se realizó el registro. Este identificador debe ser acorde con la geografía superior documentada en el elemento higherGeography. |
| Comentarios | Se recomienda utilizar un identificador persistente de un vocabulario controlado como el código de la División Política Administrativa de Colombia - DANE (https://www.datos.gov.co/api/views/gdxc-w37w/rows.pdf?accessType=DOWNLOAD) precedida por “CO:” o el Tesauro Getty de Nombres Geográficos, como se muestra a continuación: CO:15572 (Código Divipola para el Municipio de Puerto Boyacá en Boyacá) CO:68 (Código Divipola para el Departamento de Santander) TGN: 7005075 (San Agustín (Huila), Colombia) |
| Ejemplo | CO:15572 CO:68 TGN: 7005075 |
| Elementos relacionados | higherGeography, continent, country, stateProvince, county, municipality |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
| Definición | El nombre del continente en el que tiene lugar la ubicación. Documente este elemento de acuerdo a las definiciones e indicaciones que acompañan el vocabulario controlado. |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) Evento de muestreo (Recomendado) |
| Vocabulario controlado | América del Sur América del Norte Europa África Asia Oceanía Antártida |
| Definición | El nombre y tipo del cuerpo de agua en el que tiene lugar la ubicación. Se recomienda usar este elemento solamente si el evento ocurrió en el cuerpo de agua propiamente dicho, no en cercanías de este. |
| Ejemplo | Mar Caribe Océano Pacífico Río Lebrija Golfo de Urabá Caño Mojana |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) Evento de muestreo (Recomendado) |
| Definición | El nombre del grupo de islas en que tiene lugar la ubicación. |
| Ejemplo | Cayos de Albuquerque Islas del Rosario |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
| Definición | El nombre de la isla en o cerca al lugar de la ubicación. |
| Ejemplo | Isla de Providencia Isla Gorgona Isla de Tierra Bomba |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
| Definición | El nombre del país o unidad administrativa de mayor jerarquía de la ubicación. Se recomienda utilizar un identificador persistente de un vocabulario controlado como el Tesauro Getty de Nombres Geográficos o la norma ISO 3166. Se recomienda acompañar este elemento con el elemento countryCode. |
| Comentarios | La práctica recomendada es dejar este elemento en blanco si la información presente en la sección Ubicación abarca múltiples entidades en este mismo nivel administrativo o si hay incertidumbre sobre la entidad a la que corresponden los datos. Esta información de multiplicidad e incertidumbre se puede documentar en los elementos higherGeography y locality. Por ejemplo, si hay dos entidades “Colombia y Brasil”, la recomendación es dejar este elemento vacío y dejar el comentario en higherGeography y locality |
| Ejemplo | Colombia España Dinamarca |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Obligatorio) Evento de muestreo (Obligatorio) |
| Definición | El código estándar para el país de la ubicación. |
| Comentarios | Documente este elemento de acuerdo al vocabulario controlado de la norma ISO 3166-1-alfa-2 de códigos de países, como se muestra a continuación: CO (=Para Colombia) AR (=Para Argentina) La práctica recomendada es dejar este elemento en blanco si la información presente en la sección Ubicación abarca múltiples entidades en este mismo nivel administrativo o si hay incertidumbre sobre la entidad a la que corresponden los datos. Esta información de multiplicidad e incertidumbre se puede documentar en los elementos higherGeography y locality. Por ejemplo, si hay dos entidades “CO y BR”, la recomendación es dejar este elemento vacío y dejar el comentario en higherGeography y locality |
| Elementos relacionados | country |
| Ejemplo | Colombia España Dinamarca |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) Evento de muestreo (Recomendado) |
| Vocabulario controlado | Consultar en: https://es.wikipedia.org/wiki/ISO_3166-1_alfa-2#CO |
| Definición | El nombre completo y sin abreviar de la siguiente región administrativa de menor jerarquía que País de la ubicación (Departamento). Se recomienda usar los nombres asignados en la División Política Administrativa de Colombia - DANE (https://www.datos.gov.co/api/views/gdxc-w37w/rows.pdf?accessType=DOWNLOAD). |
| Comentarios | La práctica recomendada es dejar este elemento en blanco si la información presente en la sección Ubicación abarca múltiples entidades en este mismo nivel administrativo o si hay incertidumbre sobre la entidad a la que corresponden los datos. Esta información de multiplicidad e incertidumbre se puede documentar en los elementos higherGeography y locality. Por ejemplo, si hay dos entidades “Santander y Boyacá”, la recomendación es dejar este elemento vacío y dejar el comentario en higherGeography y locality. |
| Ejemplo | Antioquia Atlántico Bogotá, D.C. |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Condicional). Obligatorio cuando el registro está asociado a un permiso de recolección o de acceso a recursos genéticos - Recomendado para la buena documentación de un registro biológico Evento de muestreo (Recomendado) |
| Definición | El nombre completo y sin abreviar de la siguiente región administrativa de menor jerarquía que Departamento de la ubicación (Municipio). Se recomienda usar los nombres asignados en la División Política Administrativa de Colombia - DANE (https://www.datos.gov.co/api/views/gdxc-w37w/rows.pdf?accessType=DOWNLOAD). |
| Comentarios | La práctica recomendada es dejar este elemento en blanco si la información presente en la sección Ubicación abarca múltiples entidades en este mismo nivel administrativo o si hay incertidumbre sobre la entidad a la que corresponden los datos. Esta información de multiplicidad e incertidumbre se puede documentar en los elementos higherGeography y locality. Por ejemplo, si hay dos entidades “San Juan del Cesar o Riohacha”, la recomendación es dejar este elemento vacío y dejar el comentario en higherGeography y locality. |
| Ejemplo | Medellín Puerto Colombia Bogotá, D.C. |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Condicional). Obligatorio cuando el registro está asociado a un permiso de recolección o de acceso a recursos genéticos - Recomendado para la buena documentación de un registro biológico Evento de muestreo (Recomendado) |
municipality (Cabecera municipal / Centro poblado)
| Definición | El nombre completo y sin abreviar de la siguiente región administrativa de menor jerarquía que Municipio de la ubicación. Puede ser un centro poblado, cabecera municipal, corregimiento o inspección de policía. No utilice este elemento para el nombre de un lugar cercano que no contiene la ubicación real. Se recomienda usar los nombres asignados en la División Política Administrativa de Colombia - DANE (https://www.datos.gov.co/api/views/gdxc-w37w/rows.pdf?accessType=DOWNLOAD). |
| Comentarios | La práctica recomendada es dejar este elemento en blanco si la información presente en la sección Ubicación abarca múltiples entidades en este mismo nivel administrativo o si hay incertidumbre sobre la entidad a la que corresponden los datos. Esta información de multiplicidad e incertidumbre se puede documentar en los elementos higherGeography y locality. Por ejemplo, si hay dos entidades “San Luis o Punta Sur”, la recomendación es dejar este elemento vacío y dejar el comentario en higherGeography y locality. |
| Ejemplo | Palmitas Puerto Colombia Bogotá, D.C. |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Condicional). Obligatorio cuando el registro está asociado a un permiso de recolección o de acceso a recursos genéticos - Recomendado para la buena documentación de un registro biológico Evento de muestreo (Opcional) |
| Definición | La información geográfica más específica de la ubicación. Información geográfica de menor especificidad puede ser provista en otros elementos geográficos (higherGeography, continent, country, stateProvince, county, municipality, waterBody, island, islandGroup). Este elemento puede contener información modificada de la original para corregir errores o estandarizar la descripción. |
| Ejemplo | Ruta del Sol, kilómetro 25 entre Guaduas y La Dorada Vereda Santa Ana Quebrada Aguasclaras Parque Nacional Natural Serranía de Chiribiquete |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Condicional). Obligatorio cuando el registro está asociado a un permiso de recolección o de acceso a recursos genéticos - Recomendado para la buena documentación de un registro biológico Evento de muestreo (Recomendado) |
verbatimLocality (Localidad original)
| Definición | La descripción textual original del lugar (como fue tomada en campo o documentada en el voucher). |
| Ejemplo | km 25 Rutal del Sol, Guaduas-La Dorada Vda Santa ana Q. Aguasclaras PNN Chiribiquete |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
verbatimElevation (Elevación original)
| Definición | La descripción textual de la elevación (altitud, por lo general por encima del nivel del mar) de la ubicación. |
| Ejemplo | 100-200 m 1560 msnm |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
minimumElevationInMeters (Elevación mínima en metros)
| Definición | El límite inferior del rango de elevación (altitud, generalmente por encima del nivel del mar), no utilice ningún indicador de unidad (metros, m, msnm) ya que el elemento especifica que los valores anotados son en metros. |
| Ejemplo | 100 1600 |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Condicional). Obligatorio cuando el registro está asociado a un permiso de recolección o de acceso a recursos genéticos - Recomendado para la buena documentación de un registro biológico Evento de muestreo (Recomendado) |
maximumElevationInMeters (Elevación máxima en metros)
| Definición | El límite superior del rango de elevación (altitud, generalmente por encima del nivel del mar), no utilice ningún indicador de unidad (metros, m, msnm) ya que el elemento especifica que los valores anotados son en metros. |
| Ejemplo | 200 3050 |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) Evento de muestreo (Recomendado) |
verticalDatum (Datum vertical)
| Definición | El datum vertical usado como referencia para la obtención de los valores de elevación. Se recomienda usar un vocabulario controlado a partir de código epsg o el código del geoide de referencia. |
| Ejemplo | GRS80 EGM84 EGM96 EGM2008 epsg:7030 Desconocido |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
verbatimDepth (Profundidad original)
| Definición | La descripción textual de la profundidad bajo la superficie local. |
| Ejemplo | 0-20 m -15 a -30 |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
minimumDepthInMeters (Profundidad mínima en metros)
| Definición | La menor profundidad de un rango de profundidad por debajo de la superficie local. No utilice ningún indicador de unidad (metros, m) ya que el elemento especifica que los valores anotados son en metros. |
| Ejemplo | 0 10 |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) Evento de muestreo (Recomendado) |
maximumDepthInMeters (Profundidad máxima en metros)
| Definición | La mayor profundidad de un rango de profundidad por debajo de la superficie local. No utilice ningún indicador de unidad (metros, m) ya que el campo especifica que los valores anotados son en metros. |
| Ejemplo | 2 50 |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) Evento de muestreo (Recomendado) |
minimumDistanceAboveSurfaceInMeters (Distancia mínima de la superficie en metros)
| Definición | La menor distancia en metros en un rango de distancias, desde una superficie de referencia en dirección vertical. Si las medidas de profundidad son proporcionadas, la superficie de referencia es la ubicación determinada por la profundidad, de lo contrario la superficie de referencia es la ubicación dada por la elevación. |
| Comentarios | Utilice valores positivos para las ubicaciones por encima de la superficie y valores negativos para ubicaciones por debajo, como se muestra a continuación: -1.5 (Para un evento entre 1.5 metros y 4.5 metros desde el fondo de un lago) |
| Ejemplo | -1.5 2.8 |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
maximumDistanceAboveSurfaceInMeters (Distancia máxima de la superficie en metros)
| Definición | La mayor distancia en metros, en un rango de distancia desde una superficie de referencia en dirección vertical. Si las medidas de profundidad son proporcionadas, la superficie de referencia es la ubicación determinada por la profundidad, de lo contrario la superficie de referencia es la ubicación dada por la elevación. |
| Comentarios | Utilice valores positivos para las ubicaciones por encima de la superficie, valores negativos para las ubicaciones por debajo, como se muestra a continuación: -4.5 (Para un evento entre 1.5 metros y 4.5 metros desde el fondo de un lago) |
| Ejemplo | -4.5 8.2 |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
locationAccordingTo (Ubicación de acuerdo con)
| Definición | La información sobre la fuente de la ubicación. Podría ser una publicación (gacetero), institución o grupo de individuos. |
| Ejemplo | Tesauro Getty de Nombres Geográficos GADM Geonames Google Earth |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
locationRemarks (Comentarios de la ubicación)
| Definición | Comentarios o anotaciones sobre la ubicación. Se recomienda que la longitud de la descripción no supere 20 palabras. |
| Ejemplo | Bajo agua desde 2005 |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) Evento de muestreo (Recomendado) |
verbatimLatitude (Latitud original)
| Definición | La latitud original de la ubicación. El elipsoide de coordenadas, el datum geodésico o el sistema de referencia espacial completo (SRS) para estas coordenadas debe ser documentado en el elemento verbatimSRS, y el sistema de coordenadas en el elemento verbatimCoordinateSystem. |
| Ejemplo | 41° 05’ 56.03” S 1631599 |
| Elementos relacionados | verbatimCoordinates, verbatimCoordinateSystem, verbatimSRS, verbatimLongitude |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
verbatimLongitude (Longitud original)
| Definición | La longitud original de la ubicación. El elipsoide de coordenadas, datum geodésico o el sistema de referencia espacial completo (SRS) para estas coordenadas, debe ser documentado en el elemento verbatimSRS y el sistema de coordenadas en el elemento verbatimCoordinateSystem. |
| Ejemplo | 75° 08’ 36.83” W 834549 |
| Elementos relacionados | verbatimCoordinates, verbatimCoordinateSystem, verbatimSRS, verbatimLatitude |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
verbatimCoordinates (Coordenadas originales)
| Definición | Las coordenadas de la ubicación en su formato original. El elipsoide de las coordenadas, el datum geodésico, o el sistema de referencia espacial completo (SRS) para estas coordenadas, debe ser documentado en el elemento verbatimSRS, y el sistema de coordenadas en el elemento verbatimCoordinateSystem. |
| Ejemplo | 4° 05’ 56.03” S, 75° 08’ 36.83” W 17T 1631599 834549 |
| Elementos relacionados | verbatimLatitude, verbatimLongitude, verbatimCoordinateSystem, verbatimSRS |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
verbatimCoordinateSystem (Sistema original de coordenadas)
| Definición | El sistema de coordenadas espaciales para verbatimLatitude y verbatimLongitude original o verbatimCoordinates de la ubicación. Se recomienda el uso del vocabulario sugerido disponible para este elemento. |
| Ejemplo | Grados decimales Grados, minutos decimales Grados, minutos, segundos UTM Coordenadas planas Coordenadas proyectadas |
| Elementos relacionados | verbatimLatitude, verbatimLongitude, verbatimCoordinates, verbatimSRS |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
| Definición | El elipsoide, datum geodésico, o sistema de referencia espacial (SRS) en el que se basan las coordenadas provistas en verbatimLatitude y verbatimLongitude o verbatimCoordinates. Se recomienda usar el código EPSG, si se conoce. Caso contrario, utilice un lenguaje controlado para el nombre o código del datum geodésico, o un vocabulario controlado para el nombre o código del elipsoide, si se conoce. Si ninguno de estos se conoce, utilice el valor “Desconocido”. |
| Ejemplo | EPSG: 4326 EPSG: 3116 WGS84 UTM zone 17T MAGNA-SIRGAS origen Bogotá MAGNA-SIRGAS origen Oeste MAGNA-SIRGAS origen CTM-12 Desconocido |
| Elementos relacionados | verbatimLatitude, verbatimLongitude, verbatimCoordinates, verbatimCoordinateSystem |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
decimalLatitude (Latitud decimal)
| Definición | La latitud geográfica (en grados decimales, utilizando el sistema de referencia espacial provisto en geodeticDatum) del centro geográfico de una ubicación. Los valores positivos se encuentran al norte del ecuador, los valores negativos están al sur del mismo. Los valores admitidos se encuentran entre -90 y 90. |
| Ejemplo | 6.05486 12.584877 |
| Elementos relacionados | geodeticDatum |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Condicional). Obligatorio cuando el registro está asociado a un permiso de recolección o de acceso a recursos genéticos - Recomendado para la buena documentación de un registro biológico Evento de muestreo (Obligatorio) |
decimalLongitude (Longitud decimal)
| Definición | La longitud geográfica (en grados decimales, mediante el sistema de referencia espacial provisto en geodeticDatum) del centro geográfico de una ubicación. Los valores positivos se encuentran al este del meridiano de Greenwich, los valores negativos se encuentran al oeste de la misma. Los valores admitidos se encuentran entre -180 y 180. |
| Ejemplo | -75.05486 -72.78945 |
| Elementos relacionados | geodeticDatum |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Condicional). Obligatorio cuando el registro está asociado a un permiso de recolección o de acceso a recursos genéticos - Recomendado para la buena documentación de un registro biológico Evento de muestreo (Obligatorio) |
geodeticDatum (Datum geodésico)
| Definición | El elipsoide, datum geodésico, o sistema de referencia espacial (SRS) en el que se basan las coordenadas geográficas provistas en decimalLatitude y decimalLongitude. Se recomienda usar el código EPSG, si se conoce. Caso contrario, utilice un lenguaje controlado para el nombre o código del datum geodésico, o utilice un lenguaje controlado para el nombre o código del elipsoide, si se conoce. Si ninguno de estos se conoce, utilice el valor “Desconocido”. Aunque el estandar no es restrictivo en el datum a usar, desde el SiB Colombia se recomienda documentar las coordenadas decimales usando el datum WGS84 dado que facilita la espacialización de los datos publicados por diferentes organizaciones bajo un mismo sistema de referencia espacial, lo que minimiza el riesgo de desplazamiento de las coordenadas. |
| Ejemplo | WGS84 EPSG:4326 Desconocido |
| Elementos relacionados | decimalLatitude, decimalLongitude |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Condicional). Obligatorio cuando el registro está asociado a un permiso de recolección o de acceso a recursos genéticos - Recomendado para la buena documentación de un registro biológico Evento de muestreo (Recomendado) |
coordinateUncertaintyInMeters (Incertidumbre de las coordenadas en metros)
| Definición | La distancia horizontal (en metros) de la decimalLatitude y decimalLongitude provistas describiendo el círculo más pequeño que contiene la totalidad de la ubicación. Deje el valor vacío si la incertidumbre es desconocida, no se puede estimar, o no es aplicable (porque no hay coordenadas). Cero no es un valor válido para este elemento. |
| Comentarios | Documente este elemento de acuerdo a las siguientes explicaciones: 30 (límite inferior razonable de incertidumbre en metros para lecturas de GPS tomadas bajo buenas condiciones después de 2000-05-01, cuando la precisión no fue tomada en campo) 100 (Límite inferior razonable de incertidumbre en metros para lecturas de GPS tomadas bajo buenas condiciones antes de 2000-05-1, cuando la precisión no fue tomada en campo) 71 (Incertidumbre para coordenadas originales tomadas bajo el sistema de coordenadas UTM teniendo 100 metros de precisión y un sistema de referencia espacial conocido) |
| Ejemplo | 30 100 71 |
| Elementos relacionados | decimalLatitude, decimalLongitude |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) Evento de muestreo (Opcional) |
coordinatePrecision (Precisión de las coordenadas)
| Definición | Una representación decimal de la precisión de las coordenadas provistas en decimalLatitude y decimalLongitude. |
| Comentarios | Documente este elemento de acuerdo a las siguientes explicaciones: 0.00001 (Límite normal de GPS para grados decimales) 0.000278 (Para coordenadas reportadas al minuto más cercano. 1/3600) 0.01 (Para una coordenada decimal con dos grados decimales) 1.0 (Grado más próximo) |
| Ejemplo | 0.00001 0.000278 0.01 1.0 |
| Elementos relacionados | decimalLatitude, decimalLongitude |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
pointRadiusSpatialFit (Ajuste espacial del radio-punto)
| Definición | La relación entre el área del radio-punto (decimalLatitude, decimalLongitude y coordinateUncertaintyInMeters) y el área de la verdadera representación espacial de la ubicación (original, o más específica). Los valores válidos son 0, 1, mayor que 1, o indefinido. Un valor de 1 es una coincidencia exacta o superposición de 100%. Un valor de 0 se debe utilizar si el radio-punto dado no contiene por completo la representación original. El Ajuste espacial del radio-punto no está definido (y se debe dejar en blanco) si la representación original es cualquier geometría sin área (un punto o polilínea) y la georreferencia asignada no corresponde a esa misma geometría (sin incertidumbre). Si tanto el original como la georreferencia dada están en el mismo punto el ajuste espacial del radio-punto es 1. |
| Ejemplo | 0 1 1.5708 Indefinido |
| Elementos relacionados | decimalLatitude, decimalLongitude, coordinateUncertaintyInMeters |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
| Definición | Una representación Well-Known Text (WKT) de la forma (footprint, geometría) que define la ubicación. Una ubicación puede tener una representación de radio-punto (véase decimalLatitude) y una representación footprint, y pueden diferir entre sí. |
| Comentarios | Documente este elemento de acuerdo a las siguientes explicaciones: POLYGON ((10 20, 11 20, 11 21, 10 21, 10 20)) (Para un cuadrante con esquinas opuestas (longitud=10, latitud=20) y (longitud=11, latitud=21)) LINESTRING (-74.139299 10.689195, -74.13791 10.689422) (Para un transecto de muestreo con coordenadas iniciales (longitud=-74.139299, latitud=10.689195) y finales (longitud=-74.13791, latitud=10.689422)) |
| Ejemplo | POLYGON ((10 20, 11 20, 11 21, 10 21, 10 20)) LINESTRING (-74.139299 10.689195, -74.13791 10.689422) |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
| Definición | El Elipsoide, datum geodésico o sistema de referencia espacial sobre el cual está referenciada la geometría en el elemento footprintWKT. Se recomienda usar un código EPSG para el sistema de referencia si este es conocido. De lo contrario usar un nombre del sistema de referencia, datum, o elipsoide (SRS) bajo un vocabulario controlado. También es permitida la representación en Well-Known Text (WKT) del sistema de referencia espacial (SRS). No utilice este elemento para describir el SRS de decimalLatitude y decimalLongitude, incluso si es la misma que para WKT footprint - utilice el geodeticDatum en su lugar. |
| Ejemplo | EPSG:4326 WGS84 SRS GEOGCS[“GCS_WGS_1984”, DATUM[“D_WGS_1984”, SPHEROID[“WGS_1984”,6378137,298.257223563]], PRIMEM[“Greenwich”,0], UNIT[“Degree”,0.0174532925199433]] |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
footprintSpatialFit (Ajuste espacial de footprint)
| Definición | La relación del área de footprint (WKT footprint) y el área de la verdadera representación espacial de la ubicación (original, o más específica). Los valores válidos son 0, 1, mayor que 1, o indefinido. Un valor de 1 es una coincidencia exacta o superposición de 100%. Un valor de 0 debe ser utilizado si el footprint dado no contiene la representación original completamente. El footprintSpatialFit es indefinido (y se debe dejar en blanco) si la representación original es cualquier geometría sin área (un punto o polilínea) y la georreferencia asignada no corresponde a esa misma geometría (sin incertidumbre). Si el original y la georreferencia dada son el mismo punto, el footprintSpatialFit es 1. |
| Ejemplo | 0 1 1.5708 Indefinido |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
georeferencedBy (Georreferenciado por)
| Definición | Una lista (en una fila continua y separada por una barra vertical “|”) de los nombres de las personas, grupos u organizaciones que determinaron la georreferencia (representación espacial) para la ubicación. |
| Ejemplo | Kristina Yamamoto (MVZ) Miguel B. | María Isabel H. |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) Evento de muestreo (Recomendado) |
georeferencedDate (Fecha de georreferenciación)
| Definición | La fecha o el intervalo en la que fue georreferenciada la ubicación. Debe estar documentada en el esquema de codificación ISO 8601 (AAAA-MM-DD o para un intervalo de fechas: AAAA-MM-DD/AAAA-MM-DD). |
| Ejemplo | 2010 2010-01 2010-01-17 2009/2010 2009-02/2010-01 2009-02/10 2009-02-12/2009-10-08 2010-01-17/18 |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
georeferenceProtocol (Protocolo de georreferenciación)
| Definición | Una descripción o referencia a los métodos utilizados para determinar el footprint espacial, coordenadas, e incertidumbres. |
| Ejemplo | Chapman AD & Wieczorek JR (2020) Georeferencing Best Practices. Copenhagen: GBIF Secretariat. https://doi.org/10.15468/doc-gg7h-s853 MaNIS/HerpNet/ORNIS Georeferencing Guidelines BioGeomancer |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
georeferenceSources (Fuentes de georreferenciación)
| Definición | Una lista (en una fila continua y separada por una barra vertical “|”) de los mapas, gaceteros, u otros recursos utilizados para georreferenciar la ubicación, lo suficientemente específica como para permitir que cualquier persona en el futuro utilice los mismos recursos. |
| Ejemplo | USGS 1:24000 Florence Montana Quad Google. (n.d.). Jardín Botánico de la Universidad de Caldas. Recuperado de: https://goo.gl/maps/zPCiUySVnZ7CN2Vs7 IGAC. Cartografía básica 1:100000. Plancha 124 Google Maps, 2020, maps.google.com |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
georeferenceVerificationStatus (Estado de la verificación de la georreferenciación)
| Definición | Una descripción categórica sobre la verificación de la georreferencia usada para representar la descripción espacial de la ubicación del registro. Se recomienda el uso del vocabulario sugerido disponible para este elemento. |
| Ejemplo | Inviable para georreferenciar Requiere georreferenciación Requiere verificación Verificado por el custodio de los datos Verificado por el proveedor de los datos |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
georeferenceRemarks (Comentarios de la georreferenciación)
| Definición | Comentarios o anotaciones acerca de la determinación de la descripción espacial, los supuestos hechos que explican las adiciones formalizadas en el método referido en georeferenceProtocol. Se recomienda que la longitud de la descripción no supere 20 palabras. |
| Ejemplo | Distancia asumida a partir de la carretera (Autopista 101) |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Evento de muestreo (Opcional) |
Contexto Geológico
geologicalContextID (ID del contexto geológico)
| Definición | Un identificador para el conjunto de la información asociada con un contexto geológico (la ubicación dentro de un contexto geológico, tal como estratigrafía). Puede ser un identificador único global o un identificador específico para el conjunto de datos. |
| Ejemplo | https://opencontext.org/subjects/e54377f7-4452-4315-b676-40679b10c4d9 |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
earliestEonOrLowestEonothem (Eón temprano o eonotema inferior)
| Definición | El nombre completo del eón geocronológico más temprano o el eratema cronoestratigráfico más bajo, o el nombre informal (“Precámbrico”) atribuible al horizonte estratigráfico donde se recolectó el objeto catalogado. |
| Ejemplo | Fanerozoico Proterozoico |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
latestEonOrHighestEonothem (Eón tardío o eonotema superior)
| Definición | El nombre completo del eón geocronológico más tardío o el eratema cronoestratigráfico más alto posible, o el nombre informal (“Precámbrico”) atribuible al horizonte estratigráfico donde se recolectó el objeto catalogado. |
| Ejemplo | Fanerozoico Proterozoico |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
earliestEraOrLowestErathem (Era temprana o eratema inferior)
| Definición | El nombre completo de la era geocronológica más temprana o el eratema cronoestratigráfico más bajo, atribuible al horizonte estratigráfico donde se recolectó el objeto catalogado. |
| Ejemplo | Cenozoicoo Mesozoico |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
latestEraOrHighestErathem (Era tardía o eratema superior)
| Definición | El nombre completo de la era geocronológica más tardía o el eratema cronoestratigráfico más alto posible, atribuible al horizonte estratigráfico donde se recolectó el objeto catalogado. |
| Ejemplo | Cenozoico Mesozoico |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
earliestPeriodOrLowestSystem (Periodo temprano o sistema inferior)
| Definición | El nombre completo del periodo geocronológico más temprano posible o el sistema cronoestratigráfico más bajo, atribuible al horizonte estratigráfico donde se recolectó el objeto catalogado. |
| Ejemplo | Neógeno Terciario Cuaternario |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
latestPeriodOrHighestSystem (Periodo tardío o sistema superior)
| Definición | El nombre completo del período geocronológico más tardío posible o del sistema cronoestratigráfico más alto, atribuible al horizonte estratigráfico donde se recolectó el objeto catalogado. |
| Ejemplo | Neógeno Terciario Cuaternario |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
earliestEpochOrLowestSeries (Época temprana o serie inferior)
| Definición | El nombre completo de la época geocronológica más temprana o la serie cronoestratigráfica más baja posible, atribuible al horizonte estratigráfico donde se recolectó el objeto catalogado. |
| Ejemplo | Holoceno Pleistoceno Serie Ibexian |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
latestEpochOrHighestSeries (Época tardía o serie superior)
| Definición | El nombre completo de la época geocronológica más tardía posible o la serie cronoestratigráfica más alta, atribuible al horizonte estratigráfico donde se recolectó el objeto catalogado. |
| Ejemplo | Holoceno Pleistoceno Serie Ibexian |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
earliestAgeOrLowestStage (Edad temprana o piso inferior)
| Definición | El nombre completo de la edad geocronológica más temprana posible o piso cronoestratigráfico más bajo, atribuible al horizonte estratigráfico donde se recolectó el objeto catalogado. |
| Ejemplo | Atlántico Boreal |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
latestAgeOrHighestStage (Edad tardía o piso superior)
| Definición | El nombre completo de la edad geocronológica más tardía posible o piso cronoestratigráfico más alto, atribuible al horizonte estratigráfico donde se recolectó el objeto catalogado. |
| Ejemplo | Atlántico Boreal |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
lowestBiostratigraphicZone (Zona bioestratigráfica inferior)
| Definición | El nombre completo de la zona geológica bioestratigráfica más baja posible del horizonte estratigráfico donde se recolectó el objeto catalogado. |
| Ejemplo | Maastrichtiense |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
highestBiostratigraphicZone (Zona bioestratigráfica superior)
| Definición | El nombre completo de la zona geológica bioestratigráfica más alta posible del horizonte estratigráfico donde se recolectó el objeto catalogado. |
| Ejemplo | Blancan |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
lithostratigraphicTerms (Términos litoestratigráficos)
| Definición | La combinación de todos los nombres litoestratigráficos de la roca de donde se colectó el objeto catalogado. |
| Ejemplo | Pleistoceno-Weichseliense |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
| Definición | El nombre completo del grupo litoestratigráfico del cual se colectó el objeto catalogado. |
| Ejemplo | Grupo Bathurst |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
| Definición | El nombre completo de la formación litoestratigráfica de la cual se colectó el objeto catalogado. |
| Ejemplo | Formación Notch Peak Formación Fillmore |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
| Definición | El nombre completo del miembro litoestratigráfico del cual se colectó el elemento catalogado. |
| Ejemplo | Miembro Hellnmaria |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
| Definición | El nombre completo de la capa litoestratigráfica de la cual se colectó el elemento catalogado. |
| Ejemplo | Carbón Harlem |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
Identificación
identificationID (ID de la identificación)
| Definición | Un identificador para la identificación (el cuerpo de la información asociada con la asignación de un nombre científico) del organismo. Puede ser un identificador único global o un identificador específico para el conjunto de datos. |
| Ejemplo | 1231135 10560964 |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
identifiedBy (Identificado por)
| Definición | Una lista (en una fila continua y separada por una barra vertical “|”) de los nombres de las personas responsables de identificar el organismo. Se debe mantener el mismo formato del nombre a lo largo de todos los registros y se recomienda evitar el uso de solo iniciales ya que esto genera ambigüedades para reconocer a las personas que realizaron la identificación, de ser posible siempre escriba nombres completos. Documente el nombre de las personas y evite documentar nombres de grupos u organizaciones. |
| Ejemplo | Luis Gabriel Pérez Salamanca Jennifer Andrea Parra Ortíz | Jaime Enrique Correa Sánchez |
| Elementos relacionados | identifiedByID |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) |
identifiedByID (ID del identificador)
| Definición | Una lista (en una fila continua y separada por una barra vertical “|”) de los identificadores (ORCID o Wikidata) de las personas que identificaron el organismo. Mantenga el mismo orden de las personas documentadas en el elemento identifiedBy; el orden en este campo no indica una prioridad en la citación ni ningún otro tipo de relación jerárquica. |
| Ejemplo | https://orcid.org/0000-0001-6215-3617 | https://orcid.org/0000-0003-1691-239X https://www.wikidata.org/entity/Q28913658 |
| Elementos relacionados | identifiedBy |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) |
dateIdentified (Fecha de la identificación)
| Definición | La fecha o el intervalo durante la cual fue identificado taxonómicamente la observación, colecta o muestra. Debe estar documentada en el esquema de codificación ISO 8601 (AAAA-MM-DD o para un intervalo de fechas: AAAA-MM-DD/AAAA-MM-DD). |
| Ejemplo | 2010 2010-01 2010-01-17 2009/2010 2009-02/10 2010-01-17/18 2009-02/2010-01 2009-08-08/2009-10-26 |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) |
identificationReferences (Referencias de la identificación)
| Definición | Una lista (en una fila continua y separada por una barra vertical “|”) de las referencias (publicación, identificador único global, URI) usadas en la identificación. |
| Ejemplo | Aves del Noroeste Patagónico. Christie et al. 2004 |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
identificationVerificationStatus (Estado de la verificación de la identificación)
| Definición | Un indicador sobre el nivel de verificación de la identificación taxonómica. Puede ser un valor categórico o un porcentaje para los registros identificados con métodos genéticos. |
| Comentarios | Se recomienda el uso de categorías claras o un vocabulario controlado como el de HISPID/ABCD, como se muestra a continuación: 0 - El nombre del registro no ha sido revisado por ninguna autoridad (del vocabulario HISPID/ABCD) 1 - El nombre del registro se determinó por medio de comparación contra otro ejemplar (del vocabulario HISPID/ABCD) 2 - El nombre del registro fue determinado por un taxónomo usando material de una colección (del vocabulario HISPID/ABCD) 3 - El nombre del registro fue determinado por un taxónomo involucrado en la revisión sistemática del grupo (del vocabulario HISPID/ABCD) 4 - El registros es derivado de forma asexual de un material tipo (del vocabulario HISPID/ABCD) Verificado |
| Ejemplo | 0 1 2 3 4 Verificado No verificado 97.3% a género |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
typeStatus (Tipo nomenclatural)
| Definición | Una lista (en una fila continua y separada por una barra vertical “|”) de los tipos de nomenclatura (estado del tipo, nombre científico tipificado, publicación) aplicados al organismo. Se recomienda el uso del vocabulario sugerido disponible para este elemento con traducción a español (https://tools.gbif.org/dwca-validator/vocabulary.do?id=http://rs.gbif.org/vocabulary/gbif/type_status). |
| Ejemplo | Holotipo de Ctenomys sociabilis. Pearson O. P.; y M. I. Christie. 1985. Historia Natural; 5(37):388 Paratipo Alotipo Isotipo Neotipo Plastotipo Sintipo Topotipo |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
verbatimIdentification (Identificación original)
| Definición | La identificación original del organismo (como fue tomada en campo o documentada en el voucher). Este elemento permite documentar la identificación o determinación original inalterada, incluidos los calificadores de identificación, fórmulas híbridas, incertidumbres, etc. |
| Ejemplo | Peromyscus sp. Ministrymon sp. nov. 1 Anser anser X Branta canadensis Pachyporidae? |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) |
identificationRemarks (Comentarios de la identificación)
| Definición | Comentarios o anotaciones sobre la identificación. Se recomienda que la longitud de la descripción no supere 20 palabras. |
| Ejemplo | Se distingue entre Anthus correndera y Anthus hellmayri basado en las longitudes comparativas de las uñas Amplificación del gen 16S rRNA | Identificación bioquímica |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) |
identificationQualifier (Calificador de la identificación)
| Definición | El grado de incertidumbre de la identificación puede indicarse agregando varios términos, como aff. y cf. al nombre científico. El calificador se aplica a la parte del nombre que sigue inmediatamente al calificador y se pueden colocar delante de cualquier elemento del nombre. cf. del latín confer significa comparado con. Su uso indica que no hay certeza de la identidad de la especie (o rango taxonómico superior) hasta que se pueda hacer una comparación más detallada, por ejemplo, con algún tipo o material de referencia. aff. del latín affinis significa similar o limítrofe. Su uso indica que el material o la evidencia disponible sugiere que la especie propuesta está relacionada, tiene afinidad, pero no es idéntica, a la especie o taxón que le sigue. |
| Comentarios | Documente este elemento de acuerdo a las siguientes explicaciones: cf. agrifolia (Para Quercus cf. agrifolia, con valores acompañantes scientificName: Quercus , genus: Quercus, taxonRank: Género.) aff. Sparassidae (Para aff. Sparassidae, con valores acompañantes scientificName: Araneae, order: Araneae, taxonRank: Orden.) |
| Ejemplo | cf. agrifolia aff. Sparassidae |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) |
Taxón
scientificName (Nombre científico)
| Definición | El nombre científico canónico (sin la autoría) correspondiente a la categoría taxonómica a la que se logró la determinación del organismo observado o colectado. El nombre debe ser congruente con el elemento taxonRank, de modo que se informe a que nivel (especie, género, familia, etc.) se encuentra el nombre documentado. |
| Comentarios | Para tener en cuenta: - El nombre científico puede pertenecer a cualquier categoría taxonómica (reino, filo, clase, orden, familia, género, especie entre otros), en ningún caso es obligatorio la identificación a nivel de especie. - No debe documentar la autoría del taxón en este elemento, para ello utilice el elemento scientificNameAuthorship. - No debe documentar calificadores de identificación (“cf.”, “aff.”, etc.), para ello utilice el elemento identificationQualifier y deje en el nombre científico la categoría superior sobre la cual se tiene certeza. - No debe documentar abreviaciones que no dan cuenta de el nombre específico o hacen referencia a morfotipos (“sp.”, “sp1.”, “spp.”), para ello utilice el elemento verbatimTaxonRank. - Nombres de híbridos para algas, hongos y plantas deberían seguir las reglas del Código Internacional de Nomenclatura para algas, hongos y plantas (Schenzhen Code Articles H.1, H.2 and H.3). Utilizando el signo de multiplicación × (Unicode U+00D7, HTML ×) para identificar un híbrido, evitando usar una “x” o “X”. *Aunque oficialmente scientificName se define como el “nombre científico completo, con información de autoría y fecha si se conoce”, desde el SiB Colombia se recomienda documentar solo el nombre canónico ya que hemos notado un detrimento de la calidad de este elemento por errores de tipeo cuando se incluye siguiendo la definición oficial. |
| Ejemplo | Coleoptera Bacteria Ctenomys sociabilis Abrus pulchellus subsp. tenuiflorus |
| Elementos relacionados | taxonRank, scientificNameAuthorship, identificationQualifier, verbatimTaxonRank |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Obligatorio) Lista de chequeo (Obligatorio) |
scientificNameAuthorship (Autoría del nombre científico)
| Definición | La información de autoría correspondiente al scientificName, usando el formato acorde a las convenciones del Código Nomenclatural aplicable. |
| Ejemplo | (Torr.) J.T. Howell (Martinovský) Tzvelev (Györfi, 1952) |
| Elementos relacionados | scientificName |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) Lista de chequeo (Recomendado) |
| Definición | Un identificador único global del taxón (datos asociados a la clasificación del Taxón) de acuerdo al nombre científico documentado en el elemento scientificName. Puede ser un identificador único global o un identificador específico para el conjunto de datos. Este puede ser obtenido de bases de datos o catálogos taxonómicos globales. |
| Ejemplo | gbif.org/species/3056437 urn:lsid:marinespecies.org:taxname:124821 urn:lsid:gbif.org:usages:32567 8fa58e08-08de-4ac1-b69c-1235340b7001 |
| Elementos relacionados | scientificName |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Lista de chequeo (Obligatorio) |
scientificNameID (ID del nombre científico)
| Definición | Un identificador de los detalles de la nomenclatura (no taxonómica) de acuerdo al nombre científico documentado en el elemento scientificName. Este puede ser obtenido de catálogos taxonómicos globales. |
| Ejemplo | urn:lsid:ipni.org:names:37829-1:1.3 urn:lsid:marinespecies.org:taxname:493567 |
| Elementos relacionados | scientificName |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Condicinal). Obligatorio cuando el registro es marino Lista de chequeo (Opcional) |
higherClassification (Clasificación superior)
| Definición | Una lista de los nombres de los taxones inmediatamente superiores a la categoría del taxón del scientificName. Se recomienda ordenar la lista comenzando con la categoría más alta y separando los nombres de cada categoría, con una barra vertical “|”. Permite documentar categorías taxonómicas que no incluye el estándar (subclase, suborden, etc). |
| Ejemplo | Animalia | Chordata | Vertebrata | Mammalia | Theria | Eutheria | Rodentia | Hystricognatha | Hystricognathi | Ctenomyidae | Ctenomyini | Ctenomys Animalia | Arthropoda | Arachnida | Araneae | Paratropididae | Paratropis |
| Elementos relacionados | scientificName |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Lista de chequeo (Opcional) |
| Definición | El nombre científico completo del reino al que pertenece el taxón. |
| Ejemplo | Animalia Plantae Bacteria Chromista Fungi Protozoa Archaea |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) Lista de chequeo (Obligatorio) |
| Definición | El nombre científico completo del filo o división al que pertenece el taxón. |
| Ejemplo | Chordata Bryophyta |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) Lista de chequeo (Recomendado) |
| Definición | El nombre científico completo de la clase al que pertenece el taxón. |
| Ejemplo | Mammalia Hepaticopsida |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) Lista de chequeo (Recomendado) |
| Definición | El nombre científico completo del orden al que pertenece el taxón. |
| Ejemplo | Carnivora Monocleales |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) Lista de chequeo (Recomendado) |
| Definición | El nombre científico completo de la superfamilia a la que pertenece el taxón. |
| Comentarios | Una categoría taxonómica subordinada a un orden y superior a una familia. Acorde al ICZN, artículo 29.2, el sufijo -oidea es usado para los nombres de superfamilia. |
| Ejemplo | Achatinoidea Cerithioidea Helicoidea Hypsibioidea Valvatoidea Zonitoidea |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Lista de chequeo (Opcional) |
| Definición | El nombre científico completo de la familia al que pertenece el taxón. |
| Ejemplo | Felidae Monocleaceae |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) Lista de chequeo (Recomendado) |
| Definición | El nombre científico completo de la subfamilia al que pertenece el taxón. |
| Ejemplo | Periptyctinae Orchidoideae Sphindociinae |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) Lista de chequeo (Recomendado) |
| Definición | El nombre científico completo de la tribu a la que pertenece el taxón. |
| Ejemplo | Ortaliini Arethuseae |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Lista de chequeo (Opcional) |
| Definición | El nombre científico completo de la subtribu a la que pertenece el taxón. |
| Ejemplo | Plotinini Typhaeini |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Lista de chequeo (Opcional) |
| Definición | El nombre científico completo del género al que pertenece el taxón. |
| Ejemplo | Puma Monoclea |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) Lista de chequeo (Recomendado) |
| Definición | El nombre científico completo del género no aceptado al que pertenece el taxón. |
| Comentarios | El elemento genericName solo debe usarse para combinaciones como se muestra a continuación: Felis (para el scientificName “Felis concolor”, con los valores correspondientes de “Puma concolor” en acceptNameUsage y “Puma” en genus). |
| Ejemplo | Felis |
| Elementos relacionados | scientificName, acceptNameUsage, genus |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Lista de chequeo (Opcional) |
| Definición | El nombre científico completo del subgénero al que pertenece el taxón. Se debe incluir el género para evitar la confusión de homonimia. |
| Ejemplo | Strobus (Pinus) Puma (Puma) Loligo (Amerigo) Hieracium subgen. Pilosella |
| Elementos relacionados | genus |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) Lista de chequeo (Recomendado) |
infragenericEpithet (Epíteto infragenérico)
| Definición | El nombre científico del epíteto infragenérico (por encima de la especie, pero por debajo del género) al que pertenece el taxón. |
| Comentarios | Se usa por ejemplo para secciones en botánica como se muestra a continuación: Cracca (para scientificName Vicia sect. Cracca |
| Ejemplo | Cracca |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Lista de chequeo (Opcional) |
specificEpithet (Epíteto Específico)
| Definición | El nombre del epíteto específico presente en el scientificName cuando la determinación se hizo hasta especie u otra categoría menor. |
| Ejemplo | concolor gottsche |
| Elementos relacionados | scientificName |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) Lista de chequeo (Recomendado) |
infraspecificEpithet (Epíteto infraespecífico)
| Definición | El nombre del epíteto infraespecífico presente en el scientificName cuando la determinación se hizo con la categoría de taxón más baja o más específica por debajo del epíteto específico (parte terminal del nombre), excluyendo cualquier otra denominación de categoría. |
| Comentarios | En botánica, los nombres en la literatura y las identificaciones pueden tener múltiples rangos infraespecíficos. De acuerdo al Código Internacional de Nomenclatura para algas, hongos y plantas (Schenzhen Code Articles 6.7 & Art. 24.1), los nombres válidos tienen solamente dos epítetos, con el rango más bajo presente en infraspecificEpithet. Por ejemplo el epíteto infraespecífico para Indigofera charlieriana subsp. sessilis var. scaberrima es “scaberrima”. |
| Ejemplo | concolor oxyadenia sayi |
| Elementos relacionados | scientificName |
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cultivarEpithet (Epíteto cultivar)
| Definición | El nombre de un cultivar, grupo de cultivares, o grex (horticultura) que sigue al nombre científico. De acuerdo con las Reglas del Código de Plantas Cultivadas, el nombre de un cultivar consiste en un nombre botánico seguido de un epíteto de cultivar. |
| Comentarios | Documentar de acuerdo a como se muestra a continuación: King Edward (para el scientificName “Solanum tuberosum ‘King Edward’” y taxonRank “cultivar”) Mishmiense (para el scientificName “Rhododendron boothii Mishmiense Group” y taxonRank “grupo de cultivares”) Atlantis (para scientificName “Paphiopedilum Atlantis grex” y taxonRank “grex”) |
| Ejemplo | King Edward Mishmiense Atlantis |
| Elementos relacionados | scientificName, taxonRank |
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taxonRank (Categoría del taxón)
| Definición | La categoría taxonómica del nombre más específico presente en el scientificName. Se recomienda el uso del vocabulario sugerido disponible para este elemento. |
| Ejemplo | Reino Subreino Filo División Subfilo Subdivisión Clase Subclase Orden Suborden Familia Subfamilia Tribu Subtribu Nothogénero Género Subgénero Sección Subsección Serie Subserie Nothoespecie Especie Nothosubespecie Subespecie Variedad Subvariedad Forma Subforma |
| Elementos relacionados | scientificName |
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verbatimTaxonRank (Categoría original del taxón)
| Definición | La categoría taxonómica del nombre más específico tal y como aparece en el registro original. Se utiliza para documentar abreviaciones que dan cuenta de incertidumbres o morfotipos en el registro. |
| Ejemplo | sp1. sp2. Morfotipo1. sub-lesus prole apomict spp. |
| Elementos relacionados | scientificName |
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| Definición | El nombre o nombres comunes del taxón (en una fila continua y separada por una barra vertical “|”). |
| Ejemplo | Cóndor Andino Águila Americana Buitre | Chulo |
| Elementos relacionados | scientificName |
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taxonomicStatus (Estado taxonómico)
| Definición | El estado taxonómico que define el uso del scientificName de acuerdo a un árbol taxonómico u opinión de experto. |
| Ejemplo | Inválido Válido Aceptado Sinónimo Sinónimo homotípico Sinónimo heterotípico Ambiguo Mal aplicado |
| Elementos relacionados | scientificName |
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acceptedNameUsage (Nombre aceptado usado)
| Definición | El nombre completo, con autoría e información de fecha si se conoce, del taxón actualmente válido (zoológico) o aceptado (botánico) cuando el nombre documentado en scientificName no corresponda al nombre válido o aceptado. |
| Ejemplo | Tamias minimus Bachman, 1839 |
| Elementos relacionados | scientificName |
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acceptedNameUsageID (ID del nombre aceptado usado)
| Definición | Un identificador para el acceptedNameUsage (significado del nombre, documentado de acuerdo con alguna fuente) del taxón actualmente válido (zoológico) o aceptado (botánico). Este elemento debe usarse cuando el elemento scientificName hace referencia a un sinónimo o a un nombre ambiguo mal aplicado, para dar claridad sobre el taxón válido al que hace referencia. Este puede ser obtenido de bases de datos o catálogos taxonómicos globales. |
| Ejemplo | gbif.org/species/2435099 tsn:552479 urn:lsid:ipni.org:names:320035-2 |
| Elementos relacionados | acceptedNameUsage |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Lista de chequeo (Opcional) |
parentNameUsage (Nombre parental usado)
| Definición | El nombre completo, con autoría e información de fecha si se conoce, del taxón parental directo válido (zoológico) o aceptado (botánico), más próximo de nivel superior (en una clasificación) del elemento más específico presente en el scientificName. |
| Ejemplo | Rubiaceae Arcytophyllum Willd. Testudinae |
| Elementos relacionados | scientificName |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Lista de chequeo (Opcional) |
parentNameUsageID (ID del Nombre Parental usado)
| Definición | Un identificador para el uso del nombre (significado del nombre, documentado de acuerdo con alguna fuente) del taxón parental directo del taxón indicado en el scientificName. Por ejemplo si el scientificName corresponde a una especie, el parentNameUsageID corresponder al nombre científico del género si este hace referencia a un sinónimo o a un nombre ambiguo mal aplicado Este puede ser obtenido de bases de datos o catálogos taxonómicos globales. |
| Ejemplo | gbif.org/species/2435099 tsn:552479 urn:lsid:ipni.org:names:320035-2 |
| Elementos relacionados | parentNameUsage |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Lista de chequeo (Opcional) |
originalNameUsage (Nombre original usado)
| Definición | El nombre del taxón, con autoría e información de fecha si se conoce, tal como apareció originalmente cuando se estableció por primera vez bajo las reglas del nomenclaturalCode asociado. El basiónimo (botánica) o basónimo (bacteriología) correspondiente al scientificName o el homónimo anterior de los nombres sustituidos. |
| Ejemplo | Gasterosteus saltatrix Linnaeus 1768 |
| Elementos relacionados | scientificName, nomenclaturalCode |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Lista de chequeo (Opcional) |
originalNameUsageID (ID del Nombre original usado)
| Definición | Un identificador para el uso del nombre (significado del nombre, documentado de acuerdo con alguna fuente) en el que se estableció originalmente el scientificName, bajo las reglas del nomenclaturalCode asociado (el protónimo en zoología, basiónimo en botánica). Este puede ser obtenido de bases de datos o catálogos taxonómicos globales. |
| Ejemplo | gbif.org/species/2435099 tsn:552479 urn:lsid:ipni.org:names:320035-2 |
| Elementos relacionados | originalNameUsage |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Lista de chequeo (Opcional) |
nameAccordingTo (Nombre de acuerdo con)
| Definición | La referencia a la fuente en la que está definida o implícita la definición conceptual del taxón documentado en scientificName, tradicionalmente representado por el Latín “sensu” o “sec.” (de secundum, que significa “según”). Para los taxones que resultan de las identificaciones, una referencia a las claves, monografías, expertos y otras fuentes debe ser provista. |
| Ejemplo | Franz NM, Cardona-Duque J (2013) Description of two new species and phylogenetic reassessment of Perelleschus Wibmer & O’Brien, 1986 (Coleoptera: Curculionidae), with a complete taxonomic concept history of Perelleschus sec. Franz & Cardona-Duque, 2013. Syst Biodivers. 11: 209–236 |
| Elementos relacionados | scientificName |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Lista de chequeo (Recomendado) |
nameAccordingToID (ID del nombre de acuerdo con)
| Definición | Un identificador de la fuente/publicación en la que está definida o implícita la definición conceptual del taxón específico. Véase nameAccordingTo. Este término debe usarse para referirse al ID de taxón de un registro de taxón que representa la combinación original del nombre (el protónimo en zoología, el basiónimo en botánica). |
| Ejemplo | doi:10.1016/S0269-915X(97)80026-2 19thcenturyscience.org/HMSC/HMSC-Reports/Zool-40/README.htm |
| Elementos relacionados | nameAccordingTo |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Lista de chequeo (Opcional) |
namePublishedIn (Nombre publicado en)
| Definición | Una referencia para la publicación en que se estableció originalmente el taxón presente en el scientificName, bajo las reglas del nomenclaturalCode asociado. |
| Comentarios | La citación de la primera publicación del nombre científico documentado en este registro, no el basónimo/nombre original. Las recombinaciones usualmente no se publican en zoología, en ese caso namePublishedIn debe estar vacío. |
| Ejemplo | Pearson O. P., and M. I. Christie. 1985. Historia Natural, 5(37):388; Forel, Auguste, Diagnosies provisoires de quelques espèces nouvelles de fourmis de Madagascar, récoltées par M. Grandidier., Annales de la Societe Entomologique de Belgique, Comptes-rendus des Seances 30, 1886 |
| Elementos relacionados | scientificName, nomenclaturalCode |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Lista de chequeo (Opcional) |
namePublishedInID (ID del nombre publicado en)
| Definición | Un identificador de la publicación en que se estableció originalmente el taxón presente en el scientificName, bajo las reglas del nomenclaturalCode asociado. |
| Comentarios | La citación de la primera publicación del nombre científico documentado en este registro, no el basónimo/nombre original. Las recombinaciones usualmente no se publican en zoología, en ese caso namePublishedInID debe estar vacío. |
| Ejemplo | doi:10.1016/S0269-915X(97)80026-2 19thcenturyscience.org/HMSC/HMSC-Reports/Zool-40/README.htm |
| Elementos relacionados | namePublishedIn |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Lista de chequeo (Opcional) |
namePublishedInYear (Nombre publicado en el año)
| Definición | El año de cuatro dígitos en el que se publicó el taxón presente en el scientificName. |
| Ejemplo | 1915 2008 |
| Elementos relacionados | namePublishedIn |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Lista de chequeo (Opcional) |
taxonConceptID (ID del concepto del taxón)
| Definición | Un identificador para el concepto taxonómico al que se refiere el registro, no para los detalles de nomenclatura de un taxón. |
| Ejemplo | urn:lsid:zoobank.org:act:040832DB-2A58-4EFE-B234-AEBF222586FC |
| Elementos relacionados | scientificName |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Lista de chequeo (Opcional) |
nomenclaturalCode (Código nomenclatural)
| Definición | El código nomenclatural (o códigos en el caso de un nombre ambireinal) en virtud del cual se construye el scientificName. Se recomienda el uso del vocabulario sugerido disponible para este elemento. |
| Ejemplo | ICN ICZN BC ICNCP BioCode PhyloCode |
| Elementos relacionados | scientificName |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Lista de chequeo (Opcional) |
nomenclaturalStatus (Estado nomenclatural)
| Definición | El estado nomenclatural en la publicación original del scientificName y su conformidad con las normas pertinentes de nomenclatura. Está basado en las definiciones del nomenclaturalCode en uso y no requiere una opinión taxonómica. |
| Ejemplo | nom. ambig. nom. illeg. nom. subnud. |
| Elementos relacionados | scientificName, nomenclaturalCode |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Opcional) Lista de chequeo (Opcional) |
taxonRemarks (Comentarios del taxón)
| Definición | Comentarios o anotaciones sobre el taxón o nombre. Se recomienda que la longitud de la descripción no supere 20 palabras. |
| Ejemplo | Este nombre está mal escrito en uso común Sin estado de amenaza reportada |
| Core (Obligatoriedad) | Registros (Recomendado) Lista de chequeo (Obligatorio) |
Extensiones DwC
Las extensiones DwC están conformadas por elementos usados para documentar información adicional y específica que no se relaciona dentro del core. Las extensiones pueden ser compatibles con todos o algunos de los core. Algunas de las extensiones más frecuentemente usadas y que cuentan con traducción son:
Relación del Recurso
resourceRelationshipID (ID de la relación de los recursos)
| Definición | Un identificador para una instancia de relación entre un recurso (resourceID, el sujeto) y otro (relatedResourceID, el objeto). En caso de no contar con un identificador, se puede construir a partir de la concatenación de los occurrenceID separados por /. |
| Ejemplo | UANDES:ANDES-M:20054/UANDES:ANDES-E:1054 |
| Elementos relacionados | occurrenceID, resourceID, relatedResourceID |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Un identificador del recurso que es sujeto de la relación. |
| Comentarios | Si el registro se encuentra publicado, se recomienda documentar el mismo occurrenceID o una URL asociada. |
| Ejemplo | IAvH:CBB:PARAMOS:ANFIBIA:MUESTRA:001 UANDES:ANDES-M:20054 urn:uuid:bab4d024-b931-42b0-aa34-88e7d7f8a747 |
| Elementos relacionados | occurrenceID |
| (Obligatoriedad) | (Obligatorio) |
relatedResourceID (ID del recurso relacionado)
| Definición | Un identificador único para el recurso biológico que es el objeto de la relación. Si el registro se encuentra publicado, se recomienda documentar el mismo occurrenceID o una URL asociada. |
| Ejemplo | IAvH:CBB:PARAMOS:ANFIBIA:ESPECIMENPRESERVADO:001 UANDES:ANDES-E:1054 urn:catalog:Berggren:KB07001 |
| Elementos relacionados | occurrenceID |
| (Obligatoriedad) | (Obligatorio) |
relationshipOfResource (Tipo de relación del recurso)
| Definición | La relación del objeto respecto al sujeto. Se recomienda el uso de un vocabulario controlado. |
| Ejemplo | Duplicado de Madre de Secuencia de Huésped de Tejido de Sinonimia válida de Ubicado dentro de Muestra de Parásito de Cría de Simbionte con |
| Elementos relacionados | relationshipOfResourceID |
| (Obligatoriedad) | (Obligatorio) |
relationshipOfResourceID (ID de la relación)
| Definición | Un identificador para el tipo de relación entre el sujeto (identificado con el resourceID) y su objeto (identificado con el relatedResourceID). |
| Comentarios | Se recomienda hacer uso de los identificadores de los términos en vocabularios controlados, como la ontología de relación OBO., como se muestra a continuación: http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0002456 (para la relación “polinizado por”) https://www.inaturalist.org/observation_fields/879 (para la relación “comido por”) |
| Ejemplo | http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0002456br> https://www.inaturalist.org/observation_fields/879 |
| Elementos relacionados | relationshipOfResource |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
relationshipAccordingTo (Relación de acuerdo con)
| Definición | La fuente (persona, organización, publicación, referencia) que establece la relación entre los dos registros. |
| Ejemplo | Paola Andrea Salamanca Torres Luis Alejandro Morales Mina |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
relationshipEstablishedDate (Fecha en que se estableció la relación)
| Definición | La fecha o el intervalo en la que se estableció la relación. Debe estar documentada en el esquema de codificación ISO 8601 (AAAA-MM-DD o para un intervalo de fechas: AAAA-MM-DD/AAAA-MM-DD). |
| Ejemplo | 2010 2010-01 2010-01-17 2009/2010 2009-02/2010-01 2009-02/10 2009-02-12/2009-10-08 2010-01-17/18 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
relationshipRemarks (Comentarios de la relación)
| Definición | Comentarios o anotaciones sobre la relación entre los dos registros. Se recomienda que la longitud de la descripción no supere 20 palabras. |
| Ejemplo | Madre y cría colectadas del mismo nido Polinizador capturado en el acto Ejemplar bien conservado para extracción de ADN Parásito que genera enfermedad mortal para la especie |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
Medidas o Hechos Extendida
occurrenceID (ID del Registro biológico)
| Definición | El identificador del registro biológico asociado a la medida o hecho. Se puede utilizar para asociar más de una medida con el mismo registro biológico. |
| Ejemplo | ILVO_macro_aggregate_59206 ANH-I:2008:EH253:SUP:MHNMC:Consec.71957:Zoo1 |
| (Obligatoriedad) | (Obligatorio) |
parentMeasurementID (ID de la medida parental)
| Definición | Un identificador único para la categoría superior de la medida o hecho que agrupe esta y potencialmente otras medidas. |
| Comentarios | Puede ser un identificador único global o un identificador específico para el conjunto de datos. |
| Ejemplo | 9c752d22-b09a-11e8-96f8-529269fb1459 E1_E1_O1_M1 MedidaPico |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
measurementID (ID de la medida)
| Definición | Un identificador para la medida o hecho. Puede ser un identificador único global o un identificador específico para el conjunto de datos. El identificador puede construirse a partir de tesauros específicos como NERC (https://www.bodc.ac.uk/resources/vocabularies/vocabulary_search/) comúnmente usado para datos marinos. Puede construirse a partir de la siguiente estructura: [measurementTypeID]:[consecutivo]. |
| Ejemplo | P01/current/AREABEDS:001 MedidaPico_Color |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
measurementType (Tipo de medida)
| Definición | El nombre de la medida, hecho o característica. Puede ser abiótica, biótica o relacionada al protocolo de muestreo. Se recomienda el uso de un vocabulario controlado. |
| Ejemplo | Bióticos Estado fitosanitario Peso Longitud total Descripción gónadas Largo de cuerpo Grupo funcional Abióticos pH Clima Longitud del tramo muestreado Nombre del instrumento de muestreo Temperatura Superficie del área Altura de la orilla Tamaño del grano Color de muestra |
| Elementos relacionados | measurementTypeID, measurementValue, measurementUnit |
| (Obligatoriedad) | (Obligatorio) |
measurementTypeID (ID del tipo de medida)
| Definición | Un identificador para el valor documentado en measurementType (Identificador único global, URI), este identificador debe ser un vocabulario controlado. |
| Comentarios | Se recomienda el uso del vocabulario NERC (https://www.bodc.ac.uk/resources/vocabularies/vocabulary_search/) para datos marinos, como se muestra a continuación: http://vocab.nerc.ac.uk/collection/P01/current/LENTRACK/ (= Longitud del tramo muestreado) http://vocab.nerc.ac.uk/collection/Q01/current/Q0100002/ (= Nombre del instrumento de muestreo) P01/current/AREABEDS (= Área del fondo marino muestreada) |
| Ejemplo | http://vocab.nerc.ac.uk/collection/P01/current/LENTRACK/ http://vocab.nerc.ac.uk/collection/Q01/current/Q0100002/ P01/current/AREABEDS |
| Elementos relacionados | measurementType |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
measurementValue (Valor de la medida)
| Definición | El valor de la medida, hecho o característica documentada en el elemento measurementType. |
| Ejemplo | Bióticos Bueno Agar sangre 80.1 1.20 38 C3743 Gónadas en estado inmaduro, con tamaño uniforme Abióticos 7.8 Nublado 30 Balde |
| Elementos relacionados | measurementValueID, measurementType |
| (Obligatoriedad) | (Obligatorio) |
measurementValueID (ID del valor de la medida)
| Definición | Un identificador para los hechos documentados en measurementValue. Este puede referenciar un vocabulario controlado o una metodología en un artículo con un DOI. Cuando el campo measurementValue contiene una medida y no un hecho, debe dejarse vacío. |
| Comentarios | Se recomienda el uso del vocabulario NERC (https://www.bodc.ac.uk/resources/vocabularies/vocabulary_search/), como se muestra a continuación: http://vocab.nerc.ac.uk/collection/L22/current/TOOL0536/ (= Balde) L22/current/TOOL0653/ (= Muestreo Van Veen) |
| Ejemplo | http://vocab.nerc.ac.uk/collection/L22/current/TOOL0536/ L22/current/TOOL0653/ |
| Elementos relacionados | measurementValue |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
measurementAccuracy (Precisión de la medida)
| Definición | La descripción de los errores potenciales asociados con el measurementValue. |
| Ejemplo | 0.01 Distribución normal con variación de 2 m |
| Elementos relacionados | measurementValue |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
measurementUnit (Unidad de la medida)
| Definición | Las unidades asociadas al measurementValue. Sólo aplica para variables cuantitativas. |
| Comentarios | La práctica recomendada es utilizar el Sistema Internacional de Unidades (SI) (http://www.sc.ehu.es/sbweb/fisica_/unidades/unidades/unidades_1.html), como se muestra a continuación: g (= Gramos) m (= Metros) °C (= Grados Centígrados) |
| Ejemplo | g m °C cm s km² % hh:mm:ss |
| Elementos relacionados | measurementUnitID, measurementValue |
| (Obligatoriedad) | (Condicional). Obligatorio para variables cuantitativas |
measurementUnitID (ID de la unidad de la medida)
| Definición | Un identificador para el valor documentado en measurementUnit (Identificador único global, URI), este identificador debe ser un vocabulario controlado. |
| Comentarios | Se recomienda el uso del vocabulario NERC (https://www.bodc.ac.uk/resources/vocabularies/vocabulary_search/) para datos marinos, como se muestra a continuación: P06/current/ULAA/ (= Metros) http://vocab.nerc.ac.uk/collection/P06/current/UGRM (= Gramos) http://vocab.nerc.ac.uk/collection/P06/current/UMSQ/ (= Metros cuadrados) |
| Ejemplo | P06/current/ULAA/ http://vocab.nerc.ac.uk/collection/P06/current/UGRM http://vocab.nerc.ac.uk/collection/P06/current/UMSQ/ |
| Elementos relacionados | measurementUnit |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
measurementDeterminedDate (Fecha de la determinación de la medida)
| Definición | La fecha o el intervalo en la que se realizó la medida o hecho. Debe estar documentada en el esquema de codificación ISO 8601 (AAAA-MM-DD o para un intervalo de fechas: AAAA-MM-DD/AAAA-MM-DD). |
| Ejemplo | 2010 2010-01 2010-01-17 2009/2010 2009-02/2010-01 2009-02/10 2009-02-12/2009-10-08 2010-01-17/18 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
measurementDeterminedBy (Medida tomada por)
| Definición | Una lista (en una fila continua y separada por “|”) de los nombres de las personas, grupos u organizaciones que determinan el measuremenetValue. |
| Ejemplo | Javier Andrés de la Torre Sánchez Julie Woodruff Paerson | Eileen Lacey Smith |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
measurementMethod (Método de medida)
| Definición | Una descripción o referencia (publicación, URI) del método o protocolo utilizado para determinar la medida, hecho o característica. |
| Ejemplo | Polígono alrededor de las madrigueras Altímetro barométrico |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
measurementRemarks (Comentarios de la medida)
| Definición | Comentarios o notas que acompañan a la medida o hecho. Se recomienda que la longitud de la descripción no supere 20 palabras. |
| Ejemplo | Falta la punta de la cola Largo del pico por encima del promedio Aleta dorsal mordida Ejemplar conservado en buen estado El medio de cultivo es modificado |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
Multimedia Simple
| Definición | El tipo de recurso multimedia. Para este elemento se debe emplear el vocabulario controlado en inglés. |
| (Obligatoriedad) | (Obligatorio) |
| Vocabulario controlado | StillImage MovingImage Sound PhysicalObject Event (Para mas opciones, se puede consultar el vocabulario controlado completo en la siguiente URL: https://tools.gbif.org/dwca-validator/vocabulary.do?id=http://dublincore.org/documents/dcmi-type-vocabulary/) |
| Definición | Formato en el que se encuentra la información multimedia asociada. Es recomendado usar un formato que esté registrado en IANA (http://www.iana.org/assignments/media-types/media-types.xhtml). |
| Ejemplo | jpeg tiff mp4 mp3 MPV 3gp |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Una URL estática y pública que apunte directamente al archivo multimedia en buena resolución, se caracteriza por finalizar con el formato del archivo por ejemplo .jpg .mp3. |
| Ejemplo | https://live.staticflickr.com/65535/49971003886_9fb3569bf8_b.jpg https://www.xeno-canto.org/sounds/uploaded/DGVLLRYDXS/ZONCAP54.mp3 https://web.corral.tacc.utexas.edu/MVZ/audio/mp3/222_6560.mp3 https://static.inaturalist.org/sounds/15665.3gp?1506898805 |
| (Obligatoriedad) | (Obligatorio) |
| Definición | Una URL a la página web que contenga el archivo multimedia y sus metadatos. |
| Ejemplo | https://www.flickr.com/photos/victorsaavedramartinez/with/1866107071/ https://www.flickr.com/photos/arthur_chapman/4094078241/ https://ww2.bgbm.org/herbarium/specimen.cfm?SpecimenPK=103730 https://monarch.calacademy.org/collections/individual/index.php?occid=700648&clid=0 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | El título del objeto multimedia. |
| Ejemplo | Andorinha-do-rio (Tachycineta albiventer) Puma chileno MCZ:Herp:R-17603 Caiman crocodilus fuscus 125692 Dircenna olyras d IN |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Descripción textual y corta de la información multimedia. |
| Ejemplo | Hembra de Tachycineta albiventer fotografiada en el Amazonas, Colombia, en noviembre de 2010 Puma chileno juvenil reposando, Chile, diciembre 2020 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | La fecha o el intervalo en la que se obtuvo la información multimedia. Debe estar documentada en el esquema de codificación ISO 8601 (AAAA-MM-DD o para un intervalo de fechas: AAAA-MM-DD/AAAA-MM-DD). |
| Ejemplo | 2010 2010-01 2010-01-17 2009/2010 2009-02/10 2010-01-17/18 2009-02/2010-01 2009-08-08/2009-10-26 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Una lista (en una fila continua y separada por una barra vertical “|”) de los nombres de las personas que tomaron la información multimedia. |
| Ejemplo | Adriana Catalina Saenz Espinoza Field Museum of Natural History - Fishes Division | Kevin Andrew Swagel |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Cualquier persona que haya contribuido a la recolección, edición o procesamiento de la información multimedia. |
| Ejemplo | Camilo David Paez Zapata |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Entidad responsable de hacer la información multimedia pública. |
| Ejemplo | Herbario de la Universidad Icesia Royal Botanic Garden Edinburgh |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | La audiencia a quien va dirigida la información multimedia. Se recomienda el uso de un vocabulario controlado. |
| Ejemplo | Expertos Académicos Científicos Ornitólogos Público en general |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Si el elemento multimedia se derivó o se tomó de otra fuente, esta es la referencia a ese recurso. Por ejemplo, un libro del que se escaneó una imagen o el proveedor original de una foto / gráfico, como agencias de fotografía. |
| Ejemplo | https://proaves.org/listado-de-las-aves-de-colombia/ |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Información sobre los derechos, licencias o permisos que establece el publicador sobre el uso de la información multimedia. Se recomienda hacer uso de licencias abiertas o creative commons. |
| Ejemplo | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.0/deed.en |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
rightsHolder (ID del conjunto de datos)
| Definición | Persona u organización propietaria o administradora de los derechos de la información multimedia. |
| Ejemplo | Jardín Botánico de Quindío |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
datasetID (Titular de los derechos)
| Definición | Un identificador del conjunto de datos del cual se deriva el registro multimedia. |
| Ejemplo | J002_BIO-RRBB_SC_2021032 https://doi.org/10.15472/v24ppe |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
Referencias de Literatura
| Definición | Un enlace a la referencia, puede ser un DOI, ISBN, URI ,etc. La referencia puede ser repetida en múltiples filas para incluir múltiples identificadores que lleven al artículo o a un pdf del artículo. |
| Ejemplo | https://link.springer.com/article/10.1007/s10722-020-00960-1 https://doi.org/10.15472/jeh0ic http://www.nature.com/ng/journal/v41/n6/pdf/ng0609-637.pdf |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
bibliographicCitation (Citación bibliográfica)
| Definición | Citación bibliográfica completa en formato de texto plano. |
| Ejemplo | Granados-Martínez, C. y A. Batista. 2017. Macroinvertebrados acuáticos. Pp. 47-65. En: Lasso, C. A. y M. A. Morales-Betancourt (Eds.). III. Fauna de Caño Cristales, sierra La Macarena, Meta, Colombia. Serie Editorial Fauna Silvestre Neotropical. Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (IAvH). Bogotá, D. C., Colombia Brander, K. (2015). Improving the Reliability of Fishery Predictions Under Climate Change. Current Climate Change Reports, 1(1): 40-48. doi: 10.1007/s40641-015-0005-7 |
| (Obligatoriedad) | (Obligatorio) |
| Definición | Título del artículo, libro o fuente de citación bibliográfica documentada en bibliographicCitation. |
| Ejemplo | Macroinvertebrados acuáticos Improving the Reliability of Fishery Predictions Under Climate Change |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Autores de la citación bibliográfica documentada en bibliographicCitation. |
| Ejemplo | Granados-Martínez, C. y A. Batista Brander, K |
| Elementos relacionados | bibliographicCitation |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Fecha de la citación bibliográfica documentada en bibliographicCitation. |
| Ejemplo | 2017 2015 |
| Elementos relacionados | bibliographicCitation |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Fuente de la citación bibliográfica documentada en bibliographicCitation. Para artículos científicos, documentar el nombre de la revista. Para capítulos de libros, documentar el nombre del libro. |
| Ejemplo | Serie Editorial Fauna Silvestre Neotropical. Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt Current Climate Change Reports |
| Elementos relacionados | bibliographicCitation |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Resumen, notas o comentarios de la publicación referenciada. |
| Ejemplo | La Corporación para el Desarrollo Sostenible del Área de Manejo Especial La Macarena-Cormacarena y el Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt, decidieron realizar estudios sobre la fauna en Caño Cristales (sierra de La Macarena). Se realizó entonces una evaluación rápida de la biodiversidad de Caño Cristales en octubre 2016 a fin de caracterizar los siguientes grupos: macroinvertebrados acuáticos, peces, anfibios, reptiles, aves y mamíferos |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Lista de palabras claves (en una fila continua y separada por una barra vertical “|”) de la publicación referenciada, puede incluir la información específica de la relación del trabajo citado y la taxonomía de los registros. |
| Ejemplo | Fauna | Orinoquía | Colombia | Caño Cristales | Serranía de la Macarena | Región Neotropical | Peces | Anfibios | Reptiles |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Idioma de la publicación referenciada. |
| Ejemplo | Documente este elemento de acuerdo al vocabulario controlado de la norma ISO 639-1 de 2 letras en minúscula, como se muestra a continuación: es (=Para español) en (=Para inglés) |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Vocabulario controlado | Consultar en: http://www.loc.gov/standards/iso639-2/php/code_list.php |
| Definición | Información de los derechos de autor de la publicación referenciada. |
| Ejemplo | Todos los derechos reservados, Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt, Corporación para el Desarrollo Sostenible del Área de Manejo Especial La Macarena Cormacarena 2017 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
taxonRemarks (Comentarios del taxón)
| Definición | Comentarios o anotaciones sobre información específica del taxón relacionado con la publicación referenciada. Se recomienda que la longitud de la descripción no supere 20 palabras. |
| Ejemplo | Se registra la especie Podocnemis unifilis (tortuga terecay) como amenazada |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Usado para asignar una referencia bibliográfica a la lista de categorías taxonómicas o nomenclaturales. Se recomienda el uso de un vocabulario controlado. |
| Ejemplo | Publicación Original Combinación Monografía Flora-Fauna Lista de chequeo Legal Sitio web Experto Otro |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
datasetID (ID del conjunto de datos)
| Definición | Un identificador del conjunto de datos del cual se deriva el registro de la publicación referenciada. |
| Ejemplo | 002_BIO-RRBB_SC_2021032 https://doi.org/10.15472/v24ppe |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
Distribución de la Especie
locationID (ID de la ubicación)
| Definición | Un identificador de la región geográfica, división político administrativa o del sitio específico donde se distribuye el taxón. |
| Comentarios | Se sugiere utilizar un identificador persistente, como el código de la División Política Administrativa de Colombia - DANE, (https://www.datos.gov.co/api/views/gdxc-w37w/rows.pdf?accessType=DOWNLOAD) precedida por “CO:” o utilizar MarineRegions (https://www.marineregions.org/)) para regiones marinas, como se muestra a continuación: CO:15572 (Código Divipola para el Municipio de Puerto Boyacá en Boyacá) CO:68 (Código Divipola para el Departamento de Santander) CO:81 | CO:05 (para el Departamento Arauca y el Departamento Antioquia) http://marineregions.org/mrgid/32556 (Islas del Rosario) Si la ubicación corresponde a varias áreas geográficas, separar por una barra vertical “|”. Para otras áreas o código específicos de lugares nombrados (Topónimos) puede hacer uso de otros estándares. Ver: http://rs.gbif.org/areas/ |
| Ejemplo | CO:15572 CO:68 CO:81 | CO:05 http://marineregions.org/mrgid/32556 geonames.org/3674545/ |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | El nombre general del área en la que se distribuye el taxón. |
| Ejemplo | Región Orinoquía Región Caribe Región Orinoquía Parque Nacional Natural El Tuparro |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | El código estándar para el país de la ubicación. |
| Comentarios | Documente este elemento de acuerdo al vocabulario controlado de la norma ISO 3166-1-alfa-2 de códigos de países, como se muestra a continuación: CO (=Para Colombia) AR (=Para Argentina) |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Vocabulario controlado | Consultar en: https://es.wikipedia.org/wiki/ISO_3166-1_alfa-2#CO |
lifeStage (Etapa de desarrollo)
| Definición | Elemento para indicar que la información de distribución pertenece solamente a una etapa de vida específica del taxón. Se recomienda el uso de un vocabulario controlado. |
| Ejemplo | Huevo Juvenil Adulto Cigoto Embrión Larva Esporófito Espora Gametofito Gameto Pupa Plántula Floración Fructificación |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
occurrenceStatus (Estado del registro biológico)
| Definición | Estado que da cuenta de la presencia o ausencia de un taxón en una ubicación. Se recomienda el uso de un vocabulario controlado, preferiblemente en inglés. |
| Ejemplo | Presente Ausente |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
threatStatus (Estado de amenaza)
| Definición | Estado de amenaza de una especie de acuerdo a la IUCN (International Union for Conservation of Nature): https://www.iucnredlist.org/ o el estado en la lista del MADS (Ministerio de Medio ambiente y Desarrollo Sostenible): https://doi.org/10.15472/5an5tz. Documente este elemento de acuerdo a las definiciones e indicaciones que acompañan el vocabulario controlado. |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Vocabulario controlado | EX EW RE CR EN VU NT LC DD NA NE |
appendixCITES (Apéndice CITES)
| Definición | El número de los apéndices CITES- Convention on International Trade in Endangered Species of Wild Fauna and Flora, en el que el taxón es categorizado. Es posible tener diferentes números de los apéndices para diferentes áreas. Documente este elemento de acuerdo a las definiciones e indicaciones que acompañan el vocabulario controlado. |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Vocabulario controlado | I II III |
establishmentMeans (Medios de establecimiento)
| Definición | Una afirmación que de cuenta si un taxón ha sido introducido a un lugar y tiempo determinado a través de actividad humana directa o indirecta. Se recomienda el uso de un vocabulario controlado, preferiblemente en inglés. |
| Comentarios | Este elemento también esta siendo utilizado para documentar endemismo. |
| Ejemplo | native nativeReintroduced introduced introducedAssistedColonisation vagrant uncertain Endémica |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Contexto temporal relevante para el registro de la distribución, preferiblemente documentar como un rango de años o un año específico en el que el registro de la distribución es válido. Debe estar documentada en el esquema de codificación ISO 8601 (AAAA-MM-DD, para un intervalo de fechas: AAAA-MM-DD/AAAA-MM-DD), para un intervalo de años: AAAA/AAAA. |
| Ejemplo | 1939/1945 1900 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
startDayOfYear (Día inicial del año)
| Definición | Subcontexto temporal, útil para especies migratorias. El primer día ordinal del año en el cual hay presencia del taxón. |
| Comentarios | La numeración comienza con 1 para el 1 de enero y termina con 365 o 366 para el 31 de diciembre, como se muestra a continuación: 1 (Para el 1 de enero) 60 (Para el 1 de marzo) 160 (Para el 8 de junio) |
| Ejemplo | 1 60 160 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
endDayOfYear (Día final del año)
| Definición | Subcontexto temporal, útil para especies migratorias. El último día ordinal del año en el cual hay presencia del taxón. |
| Comentarios | La numeración comienza con 1 para el 1 de enero y termina con 365 o 366 para el 31 de diciembre, como se muestra a continuación: 120 (Para el 29 de abril) 306 (Para el 1 de noviembre) 365 (Para el 31 de diciembre) |
| Ejemplo | 120 306 365 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Fuente de la cual se obtuvo la información de distribución. Puede ser una cita bibliográfica (se recomienda formato APA), una URL de página web, etc. |
| Ejemplo | https://catalogo.biodiversidad.co/file/5f8e304877e76556702a20b8/summary Euro+Med Plantbase - the information resource for Euro-Mediterranean plant diversity (2006). Published on the Internet http://ww2.bgbm.org/EuroPlusMed/ July, 2009 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
occurrenceRemarks (Comentarios de la distribución)
| Definición | Comentarios o anotaciones sobre la distribución. Se recomienda que la longitud de la descripción no supere 20 palabras. |
| Ejemplo | Especie migratoria presente en Colombia durante el mes de junio |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
datasetID (ID del conjunto de datos)
| Definición | Un identificador del conjunto de datos del cual se deriva el registro de distribución. |
| Ejemplo | 002_BIO-RRBB_SC_2021032 https://doi.org/10.15472/ea8sek |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
Descripción del Taxón
| Definición | Elemento categórico que mejor se ajuste a lo que se quiera describir del taxón. Se recomienda el uso de un vocabulario controlado. |
| Ejemplo | Morfología Reproducción Fisiología |
| Elementos relacionados | description |
| (Obligatoriedad) | (Obligatorio) |
| Definición | Texto libre y descriptivo del taxón que coincida con la temática de la categoría dada en el elemento type. |
| Ejemplo | Dimorfismo sexual De 1 a 8 crías por evento reproductivo Las características de las aletas posteriores corresponden a la especie Schistochlamys melanopis Esta especie de rana presenta distribuciones altamente restringidas |
| Elementos relacionados | type |
| (Obligatoriedad) | (Obligatorio) |
| Definición | Fuente de la cual se obtuvo la información de la descripción del taxón. Puede ser una cita bibliográfica (se recomienda formato APA), una URL de página web, etc. |
| Ejemplo | https://catalogo.biodiversidad.co/file/5f8e304b77e76556702a222b/summary Acosta-Galvis, A.R. 2000. Ranas, Salamandras y Caecilias (Tetrapoda: Amphibia) de Colombia. Biota Colombiana: 289-319 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | El idioma de la descripción. |
| Comentarios | Documente este elemento de acuerdo al vocabulario controlado de la norma ISO 639-1 de 2 letras en minúscula, como se muestra a continuación: es (=Para español) en (=Para inglés) |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Vocabulario controlado | Consultar en: http://www.loc.gov/standards/iso639-2/php/code_list.php |
| Definición | La fecha o el intervalo en la que se realizó la descripción. Debe estar documentada en el esquema de codificación ISO 8601 (AAAA-MM-DD o para un intervalo de fechas: AAAA-MM-DD/AAAA-MM-DD). |
| Ejemplo | 2010 2010-01 2010-01-17 2009/2010 2009-02/10 2010-01-17/18 2009-02/2010-01 2009-08-08/2009-10-26 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Una lista (en una fila continua y separada por una barra vertical “|”) de los nombres de las personas responsables de realizar la descripción. |
| Ejemplo | Eduardo Amat García Javier Maldonado Ocampo Mónica Andrea Sánchez Torres | Esteban Andrés Novoa López |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Una lista (en una fila continua y separada por una barra vertical “|”) de los nombres de las entidades responsables de realizar la descripción. |
| Ejemplo | Universidad Nacional de Colombia |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | La audiencia a quien va dirigida la información de la descripción. Se recomienda el uso de un vocabulario controlado. |
| Ejemplo | Expertos Académicos Científicos Ornitólogos Público en general |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Información sobre los derechos, licencias o permisos que establece el publicador sobre el uso de la información de la descripción. Se recomienda hacer uso de licencias abiertas o creative commons. |
| Ejemplo | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.0/eed.en |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
rightsHolder (Titular de los derechos)
| Definición | Persona u organización propietaria o administradora de los derechos de la información de la descripción. |
| Ejemplo | Secretaria de Agricultura Ministerio de Medio Ambiente Secretaría Distrital de Ambiente |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
datasetID (ID del conjunto de datos)
| Definición | Un identificador del conjunto de datos del cual se deriva el registro de la descripción. |
| Ejemplo | 002_BIO-RRBB_SC_2021032 https://doi.org/10.15472/v24ppe |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
Perfil de la Especie
| Definición | Elemento que indica si un taxón es (=VERDADERO), o no es (=FALSO), marino. |
| Ejemplo | VERDADERO FALSO |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
isFreshWater (Es dulceacuícola)
| Definición | Elemento que indica si un taxón es (=VERDADERO), o no es (=FALSO), dulceacuícola. |
| Ejemplo | VERDADERO FALSO |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Elemento que indica si un taxón es (=VERDADERO), o no es (=FALSO), terrestre. |
| Ejemplo | VERDADERO FALSO |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Elemento que indica si un taxón es (=VERDADERO), o no es (=FALSO), invasor. |
| Ejemplo | VERDADERO FALSO |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Elemento que indica si un taxón es (=VERDADERO), o no es (=FALSO), híbrido. |
| Ejemplo | VERDADERO FALSO |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Elemento que indica si un taxón está (=VERDADERO), o no está (=FALSO), extinto. |
| Ejemplo | VERDADERO FALSO |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
livingPeriod (Periodo en el que vivió)
| Definición | El periodo geológico en el cual un organismo extinto estuvo vivo. Para tiempo geológicos de fósiles, lo ideal es usar un vocabulario controlado como https://es.wikipedia.org/wiki/Escala_temporal_geol%C3%B3gica. |
| Ejemplo | Paleógeno Cretácico Jurásico Triásico Pérmico |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Edad máxima del taxón expresada como número de días. |
| Ejemplo | 29000 5 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
sizeInMillimeters (Tamaño en milímetros)
| Definición | Tamaño máximo observado del taxón, dado en milímetros. Puede ser la altura, longitud o el ancho, la que sea mayor. |
| Ejemplo | 10 1700 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Peso máximo observado del taxón, dado en gramos. |
| Ejemplo | 12 3000 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Un término describiendo la forma de vida o crecimiento de un taxón. Se recomienda el uso de un vocabulario controlado. |
| Ejemplo | Epífita Fanerófito Criptófito |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Una lista (en una fila continua y separada por una barra vertical “|”), de los hábitats conocidos donde el taxón vive o vivió. |
| Ejemplo | Sabana de roble Estepa de la pre-cordillera Bosque templado Sabana seca Cavernas y hábitats subterráneos |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Una lista (en una fila continua y separada por una barra vertical “|”) , de los sexos conocidos para el taxón. Se recomienda el uso de un vocabulario controlado. |
| Ejemplo | Hembra Hermafrodita Macho Desconocido Indeterminado Ginandromorfo |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Fuente de la cual se obtuvo la información del perfil del taxón. Puede ser una cita bibliográfica (se recomienda formato APA), una URL de página web, etc. |
| Ejemplo | Acosta-Galvis, A. R. (2000). Ranas, salamandras y caecilias (Tetrapoda: Amphibia) de Colombia. Biota colombiana, 1(3). Agarwal S. K. 2018. Fundamentals of Ecology. APH Publishing, 813130342X, 9788131303429, 460 pages |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
datasetID (ID del conjunto de datos)
| Definición | Un identificador del conjunto de datos del cual se deriva el registro del perfil del taxón. |
| Ejemplo | 002_BIO-RRBB_SC_2021032 https://doi.org/10.15472/ea8sek |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
Tipos y Especímenes
typeStatus (Tipo nomenclatural)
| Definición | El tipo nomenclatural del espécimen. Se recomienda el uso de un vocabulario controlado. |
| Ejemplo | Alotipo Holotipo Alolectotipo |
| (Obligatoriedad) | (Obligatorio) |
typeDesignationType (Tipo de designación del tipo)
| Definición | La razón por la que el espécimen se designa como tipo nomenclatural. Se recomienda el uso de un vocabulario controlado. |
| Ejemplo | Designación original Monotipo Designación presente |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
typeDesignatedBy (Tipo designado por)
| Definición | La cita bibliográfica de la publicación donde se encuentra la designación de tipo nomenclatural. |
| Ejemplo | Sutherland CHN. 2009. Redescubrimiento del holotipo de Epidendrum × doroteae P.H. Allen (Orchidaceae). CEIBA, Vol. 50 Núm. 1 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
scientificName (Nombre científico)
| Definición | Para especímenes tipo nomenclatural, documentar el nombre científico originalmente utilizado en la etiqueta. No necesariamente es el mismo nombre reconocido actualmente. En el caso de especies o géneros tipo, debe ser la especie o el nombre del género que tipifique al taxón superior. |
| Ejemplo | Ctenomys sociabilis Ctenomys |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
taxonRank (Categoría del taxón)
| Definición | La categoría taxonómica del nombre más específico presente en el scientificName. Se recomienda el uso del vocabulario sugerido disponible para este elemento. |
| Ejemplo | Reino Subreino Filo División Subfilo Subdivisión Clase Subclase Orden Suborden Familia Subfamilia Tribu Subtribu Género Subgénero Sección Subsección Serie Subserie Especie Subespecie Variedad Subvariedad Forma Subforma |
| Elementos relacionados | scientificName |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
bibliographicCitation (Citación bibliográfica)
| Definición | Citación del espécimen descrito. |
| Ejemplo | Iraq: Mosul: Jabal Khantur prope Sharanish N. Zakho, in fissures rupium calc., 1200 m, Rech. 12083 (W!) |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
occurrenceID (ID del registro biológico)
| Definición | Un identificador único para el espécimen, preferiblemente un identificador único global que se pueda resolver. En ausencia de un identificador único global persistente, se recomienda construir uno a partir de la combinación: [código corto de la institución]:[código de la colección]:[número de catálogo]. No debe contener espacios en blanco o caracteres especiales. |
| Ejemplo | UCO:RESCATE_FAUNA_MULATOSII:1 UNIVALLE:CRM-UV:1974-001-1 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
institutionCode (Código de la institución)
| Definición | El nombre completo de la institución que custodia el espécimen; seguido por su acrónimo en paréntesis, si tiene. |
| Ejemplo | Ministerio de Ambiente y Desarrollo Sostenible (MADS) Universidad de Antioquia (UdeA) Jardín Botánico de Bogotá José Celestino Mutis (JBB) Universidad de los Andes (UNIANDES) |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
collectionCode (Código de la colección)
| Definición | El nombre, acrónimo, código alfanumérico, o iniciales que identifican la colección o conjunto de datos del que procede el organismo. Aunque es válido el uso del acrónimo que implemente la colección internamente se recomienda hacer uso del acrónimo registrado en: - GBIF Registry of Scientific Collections (https://www.gbif.org/grscicoll/collection/search) - Registro Único Nacional de Colecciones Biológicas-RNC (http://rnc.humboldt.org.co/admin/index.php/registros/colecciones). |
| Ejemplo | COL ANDES FMB |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
catalogNumber (Número de catálogo)
| Definición | Un identificador (preferiblemente único) asignado al espécimen en la colección biológica. Puede repetirse en caso de que los especímenes están agrupados en la colección (Lote, Frasco, Caja, etc). Debe documentarse de la misma forma que está en la etiqueta. |
| Ejemplo | 00001 1974-001-1 1732a ANDES-E0813 Lepid0784 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | La ubicación donde se colectó el espécimen. En el caso de especímenes tipo, la localidad tipo. |
| Ejemplo | Ruta del Sol, kilómetro 25 entre Guaduas y La Dorada Vereda Santa Ana Quebrada Aguasclaras Parque Nacional Natural Serranía de Chiribiquete |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | El sexo del espécimen. |
| Ejemplo | Hembra Hermafrodita Macho Desconocido Indeterminado Ginandromorfo |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Una lista (en una fila continua y separada por una barra vertical “|”) de los nombres de las personas responsables de la colecta u observación del espécimen. El colector u observador principal, especialmente si está asociado al recordNumber tomado en campo, se debe listar en primer lugar. Se debe mantener el mismo formato del nombre a lo largo de todos los registros y se recomienda evitar el uso de solo iniciales ya que esto genera ambigüedades para reconocer a las personas que realizaron el registro, de ser posible siempre escriba nombres completos. Documente el nombre de las personas y evite documentar nombres de grupos u organizaciones. |
| Ejemplo | Eduardo Amat García Javier Maldonado Ocampo Mónica Andrea Sánchez Torres | Esteban Andrés Novoa López |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Fuente de la cual se obtuvo la información del espécimen. |
| Ejemplo | https://camjol.info/index.php/CEIBA/article/view/193 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
verbatimEventDate (Fecha original del evento)
| Definición | La fecha o el intervalo en la que se colectó el espécimen. Debe estar documentada en el esquema de codificación ISO 8601 (AAAA-MM-DD o para un intervalo de fechas: AAAA-MM-DD/AAAA-MM-DD). |
| Ejemplo | 2010 2010-01 2010-01-17 2009/2010 2009-02/10 2010-01-17/18 2009-02/2010-01 2009-08-08/2009-10-26 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
verbatimLabel (Etiqueta original)
| Definición | Texto que representa la información literal que está presente en la etiqueta, carácter por carácter. Libre de interpretación, traducción o transliteración. |
| Comentarios | El contenido de este elemento no debe incluir ningún tipo de embellecimiento, prefijos, encabezados u otras adiciones al texto original. Las abreviaciones no deben ser extendidas y posibles errores de tipeo no deben ser corregidos. Las nuevas líneas presentes en la etiqueta se deben representar utilizando una barra vertical “ | ”. La práctica recomendada es utilizar solamente caracteres en la codificación UTF-8 y poner el comentario “El elemento verbatimLabel es derivado de una transcripción humana” en el elemento occurrenceRemarks. |
| Ejemplo | CARACTERIZACION DE LA FLORA DEL DEPARTAMENTO DEL CASANARE | PIPER* | Peperomia quadrangularis (J.V.Thmps.) A. Dietr. | Det: M.P. Córdoba /sep 2011 | Enredadera | COLOMBIA: Dpto Casanare, Mpio Tauramena, Vda La Urama, Localidad La Mata de la Urama Lat: 5° 03’,19,2” N, Long: 72° 48’ 58,8” W . Altitud: 182 m s.n.m., 28 Enero 2011. | Col: M .P.Córdoba, R. Ávila, L.Miranda y C. Pérez. | No. Col.: M.P.Córdoba 6161 | GOBERNACIÓN DEL CASANARE-WWF-FUNDACIÓN OMACHA | 119 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
verbatimLongitude (Longitud original)
| Definición | La longitud original donde se observó o colectó el espécimen. |
| Ejemplo | 75° 08’ 36.83” W 834549 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
verbatimLatitude (Latitud original)
| Definición | La latitud original donde se observó o colectó el espécimen. |
| Ejemplo | 41° 05’ 56.03” S 1631599 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
datasetID (ID del conjunto de datos)
| Definición | Un identificador del conjunto de datos del cual se deriva el registro del espécimen. |
| Ejemplo | I2D-BIO_2015_089 001_BIO-RRBB_SC_2019027 https://doi.org/10.15472/ympw2s |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
Muestra del Material GGBN
materialSampleType (Tipo de muestra)
| Definición | El tipo de muestra que representa el registro biológico. Se recomienda el uso de un vocabulario controlado. |
| Ejemplo | Muestra ambiental ADN Tejido Cepa cultivada Cepa conservada Clon |
| (Obligatoriedad) | (Obligatorio) |
| Definición | Recuento de la muestra (células totales, unidades formadoras de colonia, cantidad de biomasa o cantidad de ADN) por unidad de volumen. |
| Comentarios | Se recomienda expresar los valores en notación científica utilizando E como equivalente a x10^n. |
| Ejemplo | 0.81 6.74E8 >1E7 <1E2 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
concentrationUnit (Unidad de la concentración)
| Definición | Unidad en la que fue medida la concentración. |
| Ejemplo | ng/uL UFC/mL propágulos/mL μg/mL |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
methodDeterminationConcentrationAndRatios (Método para determinación de la concentración)
| Definición | Descripción del método utilizado para medir la concentración. |
| Ejemplo | Espectrofotometría Recuento en placa Recuento en cámara de Neubauer Cuantificación por Nanodrop |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
ratioOfAbsorbance260_230 (Relación de absorbancia 260/230)
| Definición | Para ADN conservado: Relación de absorbancia a 260 nm y 230 nm para evaluar la pureza del ADN. |
| Ejemplo | 1.85 1.5 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
ratioOfAbsorbance260_280 (Relación de absorbancia 260/280)
| Definición | Para ADN conservado: Relación de absorbancia a 260 nm y 280 nm para evaluar la pureza del ADN. |
| Ejemplo | 1.85 2.0 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
purificationMethod (Método de purificación)
| Definición | Para ADN conservado: Nombre del kit, institución o protocolo que realizó o se utilizó en la extracción del ADN. |
| Ejemplo | Extracción orgánica Fenol-Cloroformo, Purelink Genomic DNA extraction kit (Invitrogen) DNeasy Blood and Tissue Kit (Qiagen) |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Calidad en la que se encuentra la muestra. |
| Ejemplo | Viable Muerto o inviable Contaminada Pura Degradado |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
qualityCheckDate (Fecha de revisión de la calidad)
| Definición | La fecha o el intervalo más reciente en la que se revisó la calidad o viabilidad de la muestra. Debe estar documentada en el esquema de codificación ISO 8601 (AAAA-MM-DD o para un intervalo de fechas: AAAA-MM-DD/AAAA-MM-DD). |
| Ejemplo | 2010 2010-01 2010-01-17 2009/2010 2009-02/10 2010-01-17/18 2009-02/2010-01 2009-08-08/2009-10-26 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
qualityRemarks (Comentarios sobre la calidad)
| Definición | Comentarios o anotaciones sobre la calidad de la muestra. |
| Ejemplo | Se observó contaminación por un hongo ADN degradado |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Volumen de la muestra. |
| Ejemplo | 8 10 |
| Elementos relacionados | volumeUnit |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
volumeUnit (Unidad del volumen)
| Definición | Unidad en la que fue medido el volumen. |
| Ejemplo | µL ml |
| Elementos relacionados | volume |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Peso de la muestra. |
| Ejemplo | 1 0.2 |
| Elementos relacionados | weighUnit |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Unidad en la que fue medido el peso. |
| Ejemplo | g µg g/mol |
| Elementos relacionados | weigh |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
methodDeterminationWeight (Método de determinación del peso)
| Definición | Método que se usó para determinar el peso de la muestra. |
| Ejemplo | Gel de agarosa Pesa |
| Elementos relacionados | weigh |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
samp_size (Tamaño de la muestra)
| Definición | Cantidad de la muestra colectada. |
| Ejemplo | 20g de suelo 1g de tejido |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
DNAMeltingPoint (Temperatura de denaturación del ADN)
| Definición | Para ADN conservado: Resultado del análisis de la curva de denaturación. Los valores deben estar en °C y 3 cifras decimales. |
| Ejemplo | 85.347 94.000 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Diseño de la selección de muestras agrupadas y / o tamaño del tamiz y cantidad de muestra tamizada. |
| Ejemplo | Tamaño del tamiz: 20 µm Cantidad de muestra tamizada: 2 g |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
DNADNAHybridization (Hibridación ADN-ADN)
| Definición | Resultado de la hibridación ADN-ADN. |
| Ejemplo | 70% 85% |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
estimated_size (Tamaño estimado)
| Definición | El tamaño estimado del genoma antes de la secuenciación. |
| Ejemplo | 400 Mpb 1000 pb 50 Kpb |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
pool_dna_extracts (Combinación de extractos de ADN)
| Definición | Cantidad de extracciones de ADN combinados (si es el caso). |
| Ejemplo | 15 18 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
sampleDesignation (Designación de la muestra)
| Definición | Números adicionales de laboratorio o proyecto utilizados para identificar la muestra de ADN o tejido. |
| Ejemplo | ADN_bac_cep04 TEJ_fung_muestra01 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
Preservación GGBN
| Índice | ||
|---|---|---|
| preservationType (Tipo de preservación) |
preservationTemperature (Temperatura de preservación) |
preservationDateBegin (Fecha inicial de preservación) |
| sequence (Secuencia) |
preservationType (Tipo de preservación)
| Definición | Método utilizado para la preservación de la muestra. |
| Ejemplo | Crioconservación (Medio BHI + Glicerol 20%) Liofilización Papel |
| (Obligatoriedad) | (Obligatorio) |
preservationTemperature (Temperatura de preservación)
| Definición | Temperatura en la que está preservada la muestra. |
| Ejemplo | -196°C |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
preservationDateBegin (Fecha inicial de preservación)
| Definición | La fecha o el intervalo en la que inicia la preservación de la muestra. Debe estar documentada en el esquema de codificación ISO 8601 (AAAA-MM-DD o para un intervalo de fechas: AAAA-MM-DD/AAAA-MM-DD). |
| Ejemplo | 2010 2010-01 2010-01-17 2009/2010 2009-02/10 2010-01-17/18 2009-02/2010-01 2009-08-08/2009-10-26 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Descripción de la secuencia (orden) de diferentes observaciones realizadas a la muestra. Por ejemplo como se muestra a continuación: 1 (= Más antigua) 4 (= Más reciente) |
| Ejemplo | 1 4 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
Permiso GGBN
| Índice | ||
|---|---|---|
| permitType (Tipo de permiso) |
permitStatus (Estado del permiso) |
permitStatusQualifier (Calificador del estado del permiso) |
| permitURI (Identificador del permiso) |
permitText (Texto del permiso) |
| Definición | El tipo del permiso (documento que le permite a alguien tomar una acción que de otra manera no estaría permitida). Se recomienda el uso de un vocabulario controlado. |
| Ejemplo | Permiso para la recolección de especímenes de especies silvestres Permiso de importación Permiso de exportación Acto legal Amnistía Contrato de acceso a recursos genéticos Contrato Derechos de propiedad intelectual Derechos de autor Patente Fitosanitario Acuerdo de transferencia de material Memorando de entendimiento Organismo modificado genéticamente |
| (Obligatoriedad) | (Obligatorio) |
permitStatus (Estado del permiso)
| Definición | La información sobre la presencia, ausencia u otro estado básico de los permisos asociados a la(s) muestra(s). Se recomienda el uso de un vocabulario controlado. |
| Ejemplo | Permiso cerrado Permiso vigente Permiso no requerido Desconocido |
| (Obligatoriedad) | (Obligatorio) |
permitStatusQualifier (Calificador del estado del permiso)
| Definición | La descripción de por qué no se requirió cierto permiso o por qué se desconoce el estado del permiso. |
| Ejemplo | Las entidades adscritas al Ministerio de Medio Ambiente y Desarrollo Sostenible no requieren permiso Ningún requisito nacional para un permiso en la fecha de acceso Recolectado en tierras privadas Pre-Nagoya |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
permitURI (Identificador del permiso)
| Definición | Un enlace a la referencia del permiso con la información de recolección o envío. |
| Ejemplo | https://corponor.gov.co/ACTOSJURIDICOS/RESOLUCIONES/2015/ene0200.pdf https://www.utadeo.edu.co/files/collections/documents/field_attached_file/resolucion_anla_1715.pdf |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
permitText (Texto del permiso)
| Definición | Un texto estructurado con la información principal del permiso. Identifique a cuál de los siguientes casos corresponde a su permiso y construya el texto según las indicaciones del caso: (i) El registro biológico proviene de una entidad vinculada y adscrita al Ministerio de Medio Ambiente y Desarrollo Sostenible que no requiere un permiso de recolección. Formato: incluya los siguientes elementos separados por dos puntos (:) y sin espacios -Acrónimo de la entidad. -Número del convenio, proyecto marco o programa. -Número del sub-proyecto, o sub-convenio, si existen. -Año de inicio del convenio o proyecto. (ii) El registro biológico proviene de un proyecto amparado por un permiso de recolección de especímenes o contrato de acceso a recursos genéticos de acuerdo a lo establecido en el Decreto 1076 de 2015. Formato: incluya los siguientes elementos separados por dos puntos (:) y sin espacios -Acrónimo de la autoridad ambiental que otorgó el permiso. -Número de la resolución donde se otorga el permiso. -Año de expedición del permiso. -Acrónimo de la organización títular del permiso o el nombre del títular del permiso en caso de ser una persona natural. (iii) El registro biológico proviene de un espécimen depositado en una colección biológica por solicitud expresa de una autoridad ambiental o gubernamental mediante un acto legal. Por ejemplo, en los casos de incautación de fauna y flora silvestre por tráfico de especies. Formato: incluya los siguientes elementos separados por dos puntos (:) y sin espacios -La palabra ‘ACTO_LEGAL’. -Acrónimo de la autoridad ambiental o gubernamental que genera el acto legal. -Identificador del proceso, corresponde el número del acto legal emitido por la autoridad competente. Cuando la autoridad no genere un identificador del acto legal, corresponde al identificador del proceso asignado internamente por la colección. -Año de expedición del acto legal. (iv) El registro biológico proviene de un espécimen preservado en una colección biológica y legalizado a través de una amnistía. Formato: incluya los siguientes elementos separados por dos puntos (:) y sin espacios -La palabra ‘AMNISTÍA’ -Número de la resolución donde se otorga la amnistía -Año de expedición de la amnistía -Acrónimo de la organización que solicita la amnistía |
| Ejemplo | IAvH:CE16-062:8956:2016 SINCHI:CE17-845:2017 ANLA:1608:2017:UNAL CORNARE:5D800FGH:2015:SandraArambulo ACTO_LEGAL:CORMACARENA:34f-19:2017 ACTO_LEGAL:POLICIA_AMBIENTAL:PF-19075C:201 AMNISTÍA:8962:2019:UNIVALLE AMNISTÍA:59VI-196:2018:UNIMAG |
| (Obligatoriedad) | (Obligatorio) |
Preparación GGBN
preparationType (Tipo de preparación)
| Definición | La descripción del tipo de preparación (muestras, tejidos, ADN). |
| Ejemplo | Hoja Músculo Sangre gDNA |
| (Obligatoriedad) | (Obligatorio) |
preparationProcess (Proceso de la preparación)
| Definición | El proceso utilizado para preparar el espécimen o la muestra. También se puede utilizar para describir la propagación de fagos o plásmidos, o el proceso utilizado para extraer el ADN o ARN. |
| Ejemplo | Prensado y secado En alcohol Homogeneización química del tejido |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
preparationMaterials (Materiales de la preparación)
| Definición | Los materiales y/o productos químicos utilizados en la preparación de la muestra, tejido, muestra de ADN o ARN. |
| Ejemplo | Prensa botánica, cartón corrugado, papel periódico, horno, tijeras, lápiz Kit de Macherey-Nagel Kit sangre y tejido DNeasy |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Una lista (en una fila continua y separada por una barra vertical “|”) de los nombres de las personas que prepararon el espécimen o la muestra. |
| Ejemplo | Daniel Enrique Muñoz Silva Ana María Sánchez Ortíz | Juliana Novoa Gracia |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
preparationDate (Fecha de la preparación)
| Definición | ULa fecha o el intervalo durante la cual se realizó la preparación del espécimen o la muestra. Debe estar documentada en el esquema de codificación ISO 8601 (AAAA-MM-DD o para un intervalo de fechas: AAAA-MM-DD/AAAA-MM-DD). |
| Ejemplo | 2010 2010-01 2010-01-17 2009/2010 2009-02/10 2010-01-17/18 2009-02/2010-01 2009-08-08/2009-10-26 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
Amplificación GGBN
amplificationDate (Fecha de la amplificación)
| Definición | La fecha o el intervalo durante la cual se realizó la amplificación. Debe estar documentada en el esquema de codificación ISO 8601 (AAAA-MM-DD o para un intervalo de fechas: AAAA-MM-DD/AAAA-MM-DD). |
| Ejemplo | 2010 2010-01 2010-01-17 2009/2010 2009-02/10 2010-01-17/18 2009-02/2010-01 2009-08-08/2009-10-26 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
amplificationStaff (Amplificado por)
| Definición | Una lista (en una fila continua y separada por una barra vertical “|”) de los nombres de las personas encargadas de realizar la amplificación. |
| Ejemplo | Daniel Enrique Muñoz Silva Ana María Sánchez Ortíz | Juliana Novoa Gracia |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
amplificationSuccess (Éxito de la amplificación)
| Definición | Elemento que indica si el proceso de la amplificación resultó exitoso, o no. Altamente recomendado para documentar amplificaciones fallidas. |
| Ejemplo | Verdadero Falso Sí No |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
amplificationSuccessDetails (Detalle del éxito de la amplificación)
| Definición | Texto que describe el éxito o fallido del proceso de amplificación. |
| Ejemplo | ADN degradado Contaminación |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
amplificationMethod (Método de la amplificación)
| Definición | El método implementado para el proceso de amplificación. |
| Ejemplo | Reacción en cadena de la polimerasa (PCR) |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
primerSequenceForward (Cebador directo)
| Definición | La secuencia del cebador directo utilizado para el proceso de amplificación. |
| Ejemplo | 5′-GGCGGTACCCAAATTCCTGTGAATTAGC-3 5′-CAATGTGGATCAGGATCAACC-3′ |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
primerNameForward (Nombre del cebador directo)
| Definición | El nombre del cebador directo utilizado para el proceso de amplificación. |
| Ejemplo | Csp5K Imd5 Gfp5 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
primerReferenceCitationForward (Citación del cebador directo)
| Definición | Citación bibliográfica completa en formato de texto plano, donde se referencia el cebador directo utilizado para el proceso de amplificación. |
| Ejemplo | Fujikawa T & Iwanami T. 2012. Sensitive and robust detection of citrus greening (huanglongbing) bacterium “Candidatus Liberibacter asiaticus” by DNA amplification with new 16S rDNA-specific primers. Molecular and Cellular Probes, Volume 26, Issue 5, pages 194-197 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
primerReferenceLinkForward (URL del cebador directo)
| Definición | Un enlace a la referencia, puede ser un DOI, ISBN, URI, donde fue descrito por primera vez el cebador directo utilizado para el proceso de amplificación. |
| Ejemplo | https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0890850812000710 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
primerSequenceReverse (Cebador inverso)
| Definición | La secuencia del cebador inverso utilizado para el proceso de amplificación. |
| Ejemplo | 5′-GCCGGATCCCTGAGGGCGGGAACCCCGA-3 5′-GCCGGATCCTGCAGTTATTTGTATAGTTCATC-3′ |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
primerNameReverse (Nombre del cebador inverso)
| Definición | El nombre del cebador inverso utilizado para el proceso de amplificación. |
| Ejemplo | Csp-Imd Imd3 Gfp3 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
primerReferenceCitationReverse (Citación del cebador inverso)
| Definición | Citación bibliográfica completa en formato de texto plano, donde se referencia el cebador inverso utilizado para el proceso de amplificación. |
| Ejemplo | Fujikawa T & Iwanami T. 2012. Sensitive and robust detection of citrus greening (huanglongbing) bacterium “Candidatus Liberibacter asiaticus” by DNA amplification with new 16S rDNA-specific primers. Molecular and Cellular Probes, Volume 26, Issue 5, pages 194-197 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
primerReferenceLinkReverse (URL del cebador inverso)
| Definición | Un enlace a la referencia, puede ser un DOI, ISBN, URI, donde fue descrito por primera vez el cebador inverso utilizado para el proceso de amplificación. |
| Ejemplo | https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0890850812000710 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
purificationMethod (Método de purificación)
| Definición | El método o protocolo utilizado para purificar el producto de PCR. |
| Ejemplo | Qiagen Germantown ExoSAP-IT |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
consensusSequence (Secuencia consenso)
| Definición | Secuencia consenso derivada de todas las secuencias individuales. |
| Ejemplo | ATGAACCATATACCTGTGCAATATTTTAACTTAGCAAAGGAAAGTTATTTT AAGTATGGATTATCGGTAATCCAGCTTATNCAGATTGGTAAGTTCTAT GAACTTTGGCATGAGCCTGATACTCCTAGTGTACAACAAGTATACTC ACAAGCCGAGTTATTAGTTGGGCCATCCATGCGAAGTAGGCCTTTGG AGGTGACGCCCCCCATAGAACAAATTGCCTCGTTACTTGATATGAGA ATAATATCGCCCGGCAAAAGATCCTTNCTTCAAATGGGGTTTCCAA TTTATTCCCTTACTACTCATCTAAGTACTTTGTTGGATAAAGGTT |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
consensusSequenceLength (Longitud de la secuencia consenso)
| Definición | Longitud de la secuencia consenso dado en número de pares de bases. |
| Ejemplo | 697 849 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Un enlace al cromatograma de la secuencia consenso. |
| Ejemplo | https://www.boldsystems.org/index.php/Public_RecordView?processid=ABBAC141-12 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
barcodeSequence (Secuencia código de barras)
| Definición | Secuencia de código de barras de ADN (parte o el 100% de la secuencia consenso). |
| Ejemplo | GTTAATGCTGCTATTATGTTTATATCGTTGGGATTAGACTATATAGGCTT AATATTTATAATTGTCTATGTGGGGGCTATCGCGATTTTATTCCTGTT CGTAATTATGTTAATTCAACAGCCTAATAAGGTAGATTCTCAAGATCAC TCGCATTTTTTACCTGTAGGATTATCTGTTATATTTTTATTTTATAGTC TACTAACCAATAGCCCCAAATATATCAGCAATCCTGTTATAGGATCTAG AACTAACATTGGGGCAATTGGAAGTCATCTTTATACAACTTATTATGAA TTAGTGTTAATTGCTAGTTTGGTGCTACTAGTCGCTATGATAGGGGCGA TATTATTAGCTAAGCAGCCAAATTCACCTTTTTTATATA |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | El nombre del haplotipo (si aplica). |
| Ejemplo | TA + CA |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | El marcador genético o fragmento de ADN amplificado por PCR. |
| Ejemplo | COI rbcL 16S ITS2 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
markerSubfragment (Subfragmento del marcador)
| Definición | El nombre del subfragmento de un gen o locus. |
| Ejemplo | V6 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
geneticAccessionNumber (Número de accesión genético)
| Definición | El identificador único bajo el cual se deposita la secuencia de ADN en una base de datos pública (número de acceso GenBank / EMBL / DDBJ / Bold Systems). |
| Ejemplo | AJ675356 ABBAC141-12 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
BOLDProcessID (ID del proceso de BOLD)
| Definición | El identificador único del proceso (Process ID) con el que se deposita la secuencia de ADN en la base de datos BOLD (https://www.boldsystems.org/). |
| Ejemplo | CCOIV001-19 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
geneticAccessionURI (Identificador de accesión genético)
| Definición | Un enlace del registro relacionado en una base de datos pública (registro GenBank / DDBJ / EMBL / Bold Systems). |
| Ejemplo | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/AY126426 https://www.boldsystems.org/index.php/Public_RecordView?processid=ABBAC141-12 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Contenido de guanina-citosina dado en mol %. |
| Ejemplo | 35 60 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
chimera_check (Verificación de secuencia quimérica)
| Definición | Elemento que indica si hay una secuencia quimérica. Una secuencia quimérica es una secuencia compuesta por dos o más secuencias parentales filogenéticamente distintas. Las quimeras son generalmente artefactos de PCR que se cree que ocurren cuando un amplicón terminado prematuramente se vuelve a sellar en una cadena de ADN extraño y se copia hasta su finalización en los siguientes ciclos de PCR. El punto en el que la secuencia quimérica cambia de un padre al siguiente se llama punto de ruptura o punto de conversión. |
| Ejemplo | Verdadero Falso Sí No |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Descripción o método en cómo se realizó el ensamblaje (por ejemplo, con un ensamblador basado en texto como phrap o un ensamblador de diagrama de flujo, etc.). |
| Ejemplo | phrap |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Procedimientos operativos estándar relevantes. |
| Ejemplo | |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
finishing_strategy (Estrategia de finalización)
| Definición | Descripción para definir si el proyecto del genoma tenía la intención de producir un genoma completo o en borrador, el pliegue de cobertura de la secuenciación expresada como 2x, 3x, 18x, etc., y cuántos cóntigos se produjeron para el genoma. |
| Ejemplo | Genoma completo, 2x, 3 cóntigos |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
annot_source (Fuente de la anotación)
| Definición | Fuente de la anotación para los casos en que fue proporcionada por un jamboree comunitario o una base de datos de organismos modelo, en lugar de un remitente específico. |
| Ejemplo | |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
markerAccordance (Marcador acordado)
| Definición | El resultado de la comparación de dos marcadores de dos especímenes o cepas. Se debe proporcionar el nombre o el identificador (NCBI) de los especímenes o cepas comparadas y el porcentaje de identidad relativo. |
| Ejemplo | |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
seq_quality_check (Verificación de la calidad de la secuencia)
| Definición | Elemento para indicar si la secuencia ha sido nombrada por sistemas automáticos (= Ninguno) o si se ha sometido a un procedimiento de edición manual (por ejemplo, inspeccionando los datos crudos o los cromatogramas). Se aplica solo para secuencias que no se envían a SRA o DRA. |
| Ejemplo | Ninguno Editado manualmente |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | Nombre de los adaptadores. Los adaptadores proporcionan secuencias cebador tanto para la amplificación como para la secuenciación de los fragmentos de la librería de muestras. Se deben informar ambos adaptadores; en letras mayúsculas. |
| Ejemplo | EcoRI-adapterI, EcoRI-adapterIIo Msel forward adapter, Msel reverse adapter |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
mid (Identificadores multiplex)
| Definición | Códigos de barras moleculares, denominados Identificadores Multiplex (MIDs), que se utilizan específicamente para etiquetar muestras únicas en un ciclo de secuenciación. La secuencia se debe informar en letras mayúsculas. |
| Ejemplo | MID1 5′-ACGAGTGCGT-3′ |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
Préstamo GGBN
| Definición | Elemento que indica si una muestra o espécimen se puede, o no se puede, prestar. |
| Ejemplo | Si No |
| (Obligatoriedad) | (Obligatorio) |
blockedUntil (Bloqueado hasta)
| Definición | La fecha a partir de la cual se puede prestar la muestra o espécimen. Debe estar documentada en el esquema de codificación ISO 8601 (AAAA-MM-DD o para un intervalo de fechas: AAAA-MM-DD/AAAA-MM-DD). |
| Ejemplo | 2010 2010-01 2010-01-17 2009/2010 2009-02/10 2010-01-17/18 2009-02/2010-01 2009-08-08/2009-10-26 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
loanConditions (Condiciones del préstamo)
| Definición | Condiciones bajo las cuales se puede prestar la muestra o espécimen. |
| Ejemplo | Únicamente para instituciones no comerciales Únicamente con permiso del proveedor del material |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | La fecha en la que fue prestada la muestra o espécimen. Debe estar documentada en el esquema de codificación ISO 8601 (AAAA-MM-DD o para un intervalo de fechas: AAAA-MM-DD/AAAA-MM-DD). |
| Ejemplo | 2010 2010-01 2010-01-17 2009/2010 2009-02/10 2010-01-17/18 2009-02/2010-01 2009-08-08/2009-10-26 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
loanDestination (Destino del préstamo)
| Definición | El nombre de la persona y/o organización a la que se le prestó la muestra o espécimen. |
| Ejemplo | Pontificia Universidad Javeriana, Carlos Alberto Prieto López |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
loanIdentifier (Identificador del préstamo)
| Definición | Un identificador asociado al préstamo realizado. |
| Ejemplo | PRT020 |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | El estado actual de un espécimen o muestra con respecto a la colección identificada en collectionCode o collectionID. Se recomienda el uso de un vocabulario controlado. |
| Ejemplo | En colección Perdido Voucher en otra parte Duplicado en otra parte Consumido |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
| Definición | El nombre de la persona y/o organización de la que se recibió y autorizó el préstamo de la muestra o espécimen. |
| Ejemplo | Universidad de los Andes, María Isabel Cárdenas Contreras |
| (Obligatoriedad) | (Opcional) |
Vocabularios Controlados
basisOfRecord (Base del registro)
| Vocabulario | Definición |
|---|---|
| PreservedSpecimen | El organismo está preservado (muerto), vivió dentro de tiempos históricos y existe (o alguna vez existió) una parte física que podría ser evaluada nuevamente. Exclusivo para uso de las colecciones biológicas, las cuales custodian la evidencia física del espécimen preservado. Siempre va acompañado del elemento type documentado como “PhysicalObject”. |
| LivingSpecimen | Existe un espécimen vivo (crece o metaboliza) disponible en una colección. Exclusivo para uso de las colecciones biológicas vivas y zoológicos, las cuales custodian la evidencia física del espécimen. No aplica para partes dormantes de un espécimen preservado. Siempre va acompañado del elemento type documentado como “PhysicalObject”. |
| HumanObservation | Se emplea para observaciones directas de un organismo completo y colectas temporales (captura y liberación del espécimen in situ). También se emplea este valor si el espécimen observado fue posteriormente colectado y depositado en una colección biológica, pero el conjunto de datos no corresponde a la publicación de la colección biológica. En dicho caso se deben documentar los elementos collectionID y collectionCode para informar en qué colección se depositó el espécimen, y el Número de Catálogo (catalogNumber) dentro de la colección (o número de catálogo provisional), si este ya fue asignado. Por lo general va acompañado del elemento type documentado como “Event”; en caso de ser un registro sonoro detectado de forma directa por un humano, el elemento type se documenta como “Sound”. |
| MachineObservation | Se emplea para cualquier tipo de observación indirecta de un organismo por medio de un equipo o medio digital (grabadora de sonido, cámara trampa, entre otros), donde la evidencia del registro puede ser evaluada nuevamente: Según el caso, va acompañado del elemento type documentado como “StillImage”, “MovingImage” o “Sound”. |
| MaterialSample | Se emplea cuando la evidencia del organismo es indirecta y corresponde solo a una parte de este, por ejemplo: sangre, tejido, pelo, heces, etc. Siempre va acompañado del elemento type documentado como “PhysicalObject”. |
| FossilSpecimen | Se emplea con organismos prehistóricos con evidencia fósil que soporta su existencia. Siempre va acompañado del elemento type documentado como “PhysicalObject”. |
| Vocabulario | Definición |
|---|---|
| PhysicalObject | Evidencia física que soporta el registro biológico. Siempre complementa la base del registro (basisOfRecord): PreservedSpecimen, LivingSpecimen, MaterialSample y FossilSpecimen |
| StillImage | Una fotografía. Complementa la base del registro (basisOfRecord): MachineObservation |
| MovingImage | Un video, puede incluir sonido. Complementa la base del registro (basisOfRecord): MachineObservation |
| Sound | Registro de audio. Puede complementar la base del registro (basisOfRecord): MachineObservation y HumanObservation |
| Event | Observación de los especímenes en campo. Siempre complementa la base del registro (basisOfRecord): HumanObservation |
| Utilizar el vocabulario controlado para el idioma en la norma ISO 639-1. Solamente se usan 2 letras en minúscula, consulte la información en la página oficial de ISO http://www.loc.gov/standards/iso639-2/php/code_list.php |
establishmentMeans (Medios de establecimiento)
| Vocabulario | Definición |
|---|---|
| native | Nativo |
| nativeReintroduced | Nativo reintroducido |
| introduced | Introducido |
| introducedAssistedColonisation | Introducido con colonización asistida |
| vagrant | Errante |
| uncertain | Incierto |
degreeOfEstablishment (Grado de establecimiento)
| Vocabulario | Definición |
|---|---|
| native | Nativo |
| captive | Cautivo |
| cultivated | Cultivado |
| released | Liberado |
| failing | Fallido |
| casual | Casual |
| reproducing | Reproduciéndose |
| established | Establecido |
| colonising | Colonizando |
| invasive | Invasor |
| widespreadInvasive | Invasor ampliamente distribuido |
pathway (Ruta de introducción)
La lista completa de vocabularios controlados se encuentra disponible en https://dwc.tdwg.org/pw/#4-vocabulary. Utilice la palabra en la columna llamada controlled value. Se presentan los vocabularios más comunes a continuación:
| Vocabulario | Definición |
|---|---|
| releasedForUse | Liberado |
| otherEscape | Escape accidental |
| transportContaminant | Contaminación en transporte |
| transportStowaway | Polizón en transporte |
| corridor | Corredor |
| unaided | Sin ayuda |
occurrenceStatus (Estado del registro biológico)
| Vocabulario | Definición | Uso |
|---|---|---|
| Presente | Existe al menos un registro bien documentado de la presencia del taxón en el área. | Extensión Distribución de la Especie |
| Ausente | Existe evidencia para documentar la ausencia del taxón en el área. | Extensión Distribución de la Especie |
| present | Se encontró evidencia de la presencia de un organismo en el momento y lugar del registro biológico | Core Registros |
| absent | No se encontró evidencia de la presencia de un organismo en el momento y lugar de la toma del registro biológico bajo un protocolo establecido específicamente para su detección | Core Registros |
| Vocabulario |
|---|
| América del Sur |
| América del Norte |
| Europa |
| África |
| Asia |
| Oceanía |
| Antártida |
| Utilizar el vocabulario controlado de la norma ISO 3166-1-alfa-2 de códigos de países. Solamente se usan 2 letras en mayúscula, consulte la información en la página https://es.wikipedia.org/wiki/ISO_3166-1_alfa-2#CO |
threatStatus (Estado de amenaza)
| Vocabulario | Definición |
|---|---|
| EX | Especies extintas |
| EW | Especies extintas en vida silvestre |
| RE | Especies extintas regionalmente |
| CR | Especies en peligro crítico |
| EN | Especies en peligro |
| VU | Especies en estado vulnerable |
| NT | Especies casi amenazadas |
| LC | Especies en estado de amenaza de menor preocupación |
| DD | Especies con datos deficientes del estado de amenaza |
| NA | Especies que no aplica el estado de amenaza |
| NE | Especies no evaluadas en términos de estado de amenaza |
appendixCITES (Apéndice CITES)
| Vocabulario | Definición |
|---|---|
| I | Apéndice I que incluye todas las especies en peligro de extinción que están o pueden verse afectadas por el comercio. |
| II | Apéndice II que incluye las especies que aunque no están amenazadas pueden llegar a estarlo de no reglamentar su comercio de manera estricta. |
| III | Apéndice III que incluye las especies que sujetas a regulación dentro de cualquier jurisdicción con el propósito de prevenir o restringir la explotación, y que necesitan la cooperación de otras Partes en el control del comercio. |
| Vocabulario | Definición |
|---|---|
| Collection | Colección |
| Dataset | Conjunto de datos |
| Event | Evento |
| Image | Imagen |
| InteractiveResource | Recurso interactivo |
| Service | Servicio |
| Software | Programa |
| Sound | Sonido |
| Text | Texto |
| PhysicalObject | Objeto físico |
| StillImage | Fotografía |
| MovingImage | Video |