Amanita muscaria Fotografía de: Quimbaya Flickr

Plantillas Darwin Core

Esta serie de plantillas son punto de partida para facilitar la estandarización de datos haciendo uso del Darwin Core (DwC).

Para la publicación de datos sobre biodiversidad se han creado tres plantillas de acuerdo a los tipo de datos que se pueden compartir a través del SiB Colombia. Estas plantilla están estructuradas bajo el estándar Darwin Core y cuenta con los elementos necesarios del Core del estándar para la publicación.

Si tu conjunto de datos cuenta con datos relacionados como rasgos funcionales, referencias bibliográficas, secuencias genéticas, imágenes, vídeo, sonidos, entre otros, y deseas que hagan parte de la publicación, recuerda mencionarlo en el correo que envíes para inciar el proceso de acompañamiento a la publicación y se te apoyará en la estructuración y ajuste de estos datos adicionales, posiblemente con el uso de las extensiones del estándar Darwin Core.

Recomendaciones

  • Lee la hoja de instrucciones de cada plantilla para conocer su estructura, modo de navegación y uso.

  • Documenta en las plantillas sólo los datos que poseas o puedas inferir, si no cuentas con datos para llenar alguno de los elementos (columnas) de la plantilla, sólo debes eliminarlo. Esto no aplica para los campos obligatorios o requeridos los cuales son indispensables para la publicación de datos.

  • Si tienes algún comentario o inquietud acerca de las plantillas por favor realízalo a través del correo sib@humboldt.org.co.

Plantillas

Registros biológicos

Usa esta plantilla si tus datos:

  • Corresponden a avistamientos directos de especímenes, colectas temporales o capturas in situ (en su hábitat natural) que estarán asociadas a un voucher o soporte de referencia físico.
  • Documentan atributos como: nombre científico, fecha de colecta, ubicación, sexo, edad, comportamiento, etc., de un organismo o grupo de organismos dentro de un contexto específico.
  • Estan soportados por una fotografía, un sonido u otro tipo de soporte digital, o por el espécimen en físico do en una colección biológica, museo de historia natural, herbario, etc.
Descargar última versión v3.5

Cambios realizados respecto a la versión 3.4:

  • Definiciones actualizadas
    • basisOfrecord
    • disposition
    • preparations
    • organismQuantity
    • organismQuantityType
  • Cambio de obligatoriedad
    • El elemento individualCount deja de ser obligatorio y pasa a ser recomendado.
    • El elemento organismQuantity deja de ser opcional y pasa a ser obligatorio para registros biológicos colectados bajo un permiso de recolección de especímenes o acceso a recursos genéticos.
    • El elemento organismQuantityType deja de ser opcional y pasa a ser obligatorio para registros biológicos colectados bajo un permiso de recolección de especímenes o acceso a recursos genéticos.
    • El elemento disposition deja de ser opcional y pasa a ser obligatorio para registros biológicos colectados bajo un permiso de recolección de especímenes o acceso a recursos genéticos.
    • El elemento preparations deja de ser recomendado y pasa a ser obligatorio para registros biológicos colectados bajo un permiso de recolección de especímenes o acceso a recursos genéticos.
  • Cambios en las instrucciones
    • Se añaden elementos obligatorios a la tabla de instrucciones
    • Actualización citación
Historial de versiones Plantilla de Registros Biológicos v3.4

Cambios realizados respecto a la versión 3.3:

  • Definiciones actualizadas
    • basisOfrecord
    • institutionCode
    • collectionCode
    • catalogNumber
    • type
    • institutionID
    • collectionID
    • datasetID
    • datasetName
    • scientificName
  • Cambio de obligatoriedad
    • El elemento catalogNumber deja de ser obligatorio y pasa a ser condicional.
    • El elemento type deja de ser recomendado y pasa a ser obligatorio.
    • El elemento otherCatalogNumbers deja de ser obligatorio para registros biológicos colectados bajo un permiso de recolección de especímenes o acceso a recursos genéticos.
    • El elemento datasetName pasa a ser obligatorio para registros biológicos colectados bajo un permiso de recolección de especÌmenes o acceso a recursos genéticos.
    • El elemento datasetID pasa a ser obligatorio para los registros biológicos colectados bajo un permiso de recolección de especímenes o acceso a recursos genéticos.
    • El elemento preparations pasa a ser recomendado.
    • El elemento taxonRank pasa a ser obligatorio.
  • Cambios en las instrucciones
    • Actualización enlaces.
    • Se incluye una tabla describiendo los elementos obligatorios según el origen de los registros biológicos.
    • Creación de una nueva categoría de obligatoriedad: 'Elemento obligatorio para al menos un tipo de registro biológico y recomendado en al documentación de un buen registro biológico'.
    • Actualización menor en los textos.
    • Cambios menores en el diseño para mejor visibilidad de la tabla.
    • Actualización citación
Plantilla de Registros Biológicos v3.3

Revisada y editada 2017-11

Plantilla de Registros Biológicos v3.1

Revisada y editada 2017-04

Plantilla de Registros Biológicos v3.0

Revisada y editada 2013-11

Plantilla de Registros Biológicos v2.0

Revisada y editada 2013-05

Plantilla de Registros Biológicos v1.0

Revisada y editada 2012

Plantilla CR-SiB v1.0

Creada en 2014-05. A partir de 2019-09 se unifica con las plantillas de publicación de registros biológicos v3.5.


Listas de especies

Use esta plantilla si sus datos:

  • Describen principalmente los atributos taxonómicos (nombre científico, taxonomía superior, nombre común, etc.) válidos para una especie o taxón.
  • Se les puede dar un alcance temático, filogenético o geográfico común a todos los taxones en la lista. Por ejemplo: “Lista de animales amenazados”; o un alcance espacial que establece límites geográficos a todos los taxones en la lista , por ejemplo “Plantas de Chocó”.
  • Tienen idealmente un soporte que permite confirmar su alcance: registro biológico, información secundaria (literatura), etc.
Descargar última versión v3.2

Revisada y editada 2017-11

Historial de versiones Plantilla de Listas v3.0

Revisada y editada 2013-11

Plantilla de Listas v2.0

Revisada y editada 2013-05

Plantilla de Listas v1.0

Revisada y editada 2012


Eventos de muestreo

Use esta plantilla si sus datos:

  • Provienen de protocolos estandarizados para medir y observar la biodiversidad, con una medida de la abundancia de especies en la muestra.
  • Corresponden a muestreos realizados a lo largo del tiempo en parcelas permanentes, censos estandarizados, muestras de suelos para análisis metagenómicos, caracterizaciones de fitoplancton, etc., con un identificador del evento claramente establecido.
  • No solo documentan atributos de un registro biológico, sino también el detalle suficiente para determinar la composición de una comunidad o abundancia relativa de las especies en diferentes momentos del tiempo.
Descargar última versión v1.1

Revisada y editada 2014-05

Extensiones

Use esta plantillas si sus datos:

  • Incluyen rasgos funcionales (medidas) del organismo representado en los registros biológicos.
  • Incluyen recursos multimedia como imágenes, videos, sonidos, etc. almacenados en un repositorio externo y cuyos contenidos pueden ser accedidos vía URL.
  • Corresponde a listas de especies con información de distribución de la especie, tales como país, localidad, habitat, estado de amenaza, etc.
Medidas o Hechos

Revisada y editada 2021-06

Multimedia Simple

Revisada y editada 2021-06

Distribución de especies

Revisada y editada 2021-06